PythonとCytoScapeを使ってクラスタリングと可視化 - Qiita

概要 クラスタリングは簡易であり，有益な結果を得やすいデータ分析の手法です． もともとネットワーク構造のであるデータはもちろんのこと，ネットワーク構造でないデータに関しても距離関数を定義することでネットワーク化し，クラスタリングをすることができます． このエントリではクラスタリングを行い，その結果を可視化する方法について紹介します． ネットワークとは そもそもネットワーク構造とはなんでしょうか？ 一般的にはノードとエッジから構成されるデータのことであり， エッジには方向がついていたりついていなかったりします 方向があるものを有向グラフ, ないものを無向グラフといいます． エッジに重みがあるものもないものもあり，あるものを重み付きグラフといいます． クラスタリングとは データの集合をいくつかのまとまり(部分集合)に分けることです それぞれの部分集合がある共通の特徴を持つように分けます ネット