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Q & A
Q1. モチーフとは? 現在のSALADデータベースでは、同一種内、また、異種間のアノテーション(タンパク... Q1. モチーフとは? 現在のSALADデータベースでは、同一種内、また、異種間のアノテーション(タンパク質のアミノ酸配列)から、進化上に保存されているアミノ酸配列をモチーフと定義しています。機能の注釈(説明)を重視するPfamデータベース等のドメインの概念と区別するためです。また、そのため、Pfamドメインとの相対関係をグラフィカルに表示できるようにもなっています。 具体的には、「MEME」というソフトウェアで抽出した保存配列(8~50アミノ酸)を確率的な閾値でフィルタをかけたものをモチーフとして取り扱っています。 なお、現在のバージョンでは、グループごとにモチーフを抽出しているので、統一されたIDは割り振っていません。IDの割り振りはVer.2での実現に向けて、準備中です。 Q2. 結果をプリントアウトしたり、パワーポイント等に使うには? PDFをダウンロードして印刷 [PDF for