Papers on normalization, variable selection, classification or clustering of microarray data
Over the last decade or so, there have been large numbers of methods published on approaches for normalization, variable (gene) selection, classification and clustering of microarray data. As indicated in the scope document for Bioinformatics, this requires papers describing new methods for these problems to meet a very high standard, showing important improvement in results for real biological da
Microarray Analysis | Thermo Fisher Scientific - JP
Microarray technology enables the flexible throughput analysis of genotyping, chromosome copy number variations and gene expression. It can be applied to various applications such as predictive genomics, reproductive health and oncology research. Stay up to date with the latest news on microarray technologies from Thermo Fisher Scientific.
Home | JKU Visual Data Science Lab
About Welcome to the home of the Visual Data Science Lab! We are part of the Institute of Computer Graphics at the Johannes Kepler University Linz in Austria. Our research focuses on developing novel visual analysis methods and tools that enable users to make sense of complex and heterogeneous data. With our solutions we target problems from various fields of application, including cancer research
Functional Genomics Unit
このサイトは、理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター 機能ゲノミクスユニットのウェブページです。我々のチームは2つのミッションを持って研究を進めています。 機能ゲノミクス技術の開発・提供 機能ゲノミクス技術を用いた生命原理の解明 この募集については、多能性幹細胞研究チーム (チームリーダー 丹羽仁史)の所属になります。 【研究室の概要】 多能性幹細胞研究チームでは、マウスＥＳ細胞の多能性を維持する分子機構を、転写因子とエピジェネティック制御機構を中心に解析し、そのネットワーク性を明らかにすることにより、幹細胞の自己複製と分化を普遍的に支配する原理の解明を目指しています。 Niwa et al, Nature, in press. Toyooka et al, Development, 135, 909, 2008. Niwa, Genes Dev, 21, 2671, 2007
Oligo/BAC CGH Array 解析パッケージをまとめてみる - 気の向くままに
書きかけです‥下書きで保存すると結局公開しないことが多発するので。 また来週に改訂するつもり。 目的・動機 今回は普段自分が使っていないプラットフォームの CGH マイクロアレイを解析 & 自分の実験データと比較するために、他社のプラットフォームを解析するためのツール (パッケージ) をここに集めておく *1。 対象とするのは BAC とアジレント社製の CGH アレイ。# だったけど Affy と共用のものもある 背景 今やっている研究では Affymetrix 社製の GenomeWideSNP 6.0 array というアレイを用いて染色体の構造異常を解析している。 また最近になって各種の精神疾患で多くの染色体構造異常が報告されまくっている*2。そしてこれらデータは論文で発表されるとともに NCBI GEO でも利用可能になっている (ものもある)。 ここからパッケージたち cghM
マイクロアレイ解析 | Thermo Fisher Scientific - JP
日本人に特化したApplied Biosystems™ Axiom™ ジャポニカアレイ🄬 NEO さまざまな人種に対応したAxiom PMDA Arrayなど 薬理ゲノミクス用Axiom PharmacoScan, PharmacoFocus Array SARS-CoV-2用ジェノタイピングアレイ Axiom Propel ワークフローソリューション 遺伝子発現解析 ジャポニカアレイ® は国立大学法人東北大学の登録商標です。 ジャポニカアレイ® NEO は、Life Technologies Corporation, part of Thermo Fisher Scientific Inc. が東北大学よりライセンスを受けて製造・販売しています。ジャポニカアレイ® NEO に搭載されている疾患関連 SNP マーカーはすべて研究用途です。
Mathematical Modelling in Cell Biology From High-Throughput Data to Systems Analysis (application/pdf オブジェクト)
Mathematical Modelling in Cell Biology From High-Throughput Data to Systems Analysis Dissertation zur Erlangung des Doktorgrades der Fakultät für Mathematik und Physik der Albert-Ludwigs-Universität Freiburg im Breisgau vorgelegt von Kilian Bartholomé 24. Januar 2008 Dekan: Prof. Dr. J. Flum Leiter der Arbeit: Prof. Dr. J. Timmer Referent: Prof. Dr. J. Timmer Koreferent: Prof. Dr. H. Römer Tag de
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A comparison of batch effect removal methods for enhancement of prediction performance using MAQC-II microarray gene expression data
Site Search | GenomeWeb
Announcing the death of the Micro-array - InSightu Blog | Nature Publishing Group
Intrinsic transition of embryonic stem-cell differentiation into neural progenitors - Nature
https://mkt.illumina.com/webinar-rna-series-fall-2010.html
Site Search | GenomeWeb
SynTReN: a generator of synthetic gene expression data for design and analysis of structure learning algorithms - PubMed
compbio / ChIP-on-chip on Tiling Microarrays
RNA-seq: An assessment of technical reproducibility and comparison with gene expression arrays
Non-equilibrium thermodynamics of gene expression and transcriptional regulation
Schattauer Verlag
Seeded Bayesian Networks: Constructing genetic networks from microarray data - BMC Systems Biology
Method for single-cell microarray analysis and application to gene-expression profiling of GABAergic neuron progenitors - ScienceDirect