【記者発表】タンパク質が「形」を保つ力の超並列測定法 ――タンパク質科学のAI開発にも貢献――
○発表のポイント： ◆タンパク質の構造的な安定性を超並列に測定する方法を開発した。 ◆従来は一度に1種類のタンパク質についての構造安定性しか測定できなかったが、90万種類程度をまとめて測定することに成功した。 ◆疾患の原因となるアミノ酸変異の特定やタンパク質医薬の効率的な合成を補助するAI開発への貢献が期待される。 タンパク質構造安定性に重要な部位を示した「解剖図」 ○発表概要： 東京大学 生産技術研究所 坪山 幸太郎 講師 (研究当時、ノースウェスタン大学、ポスドク)と、ノースウェスタン大学 ガブリエル ロックリン 助教らによる研究グループは、タンパク質の構造安定性を効率よく測定する方法の樹立に成功しました。 タンパク質の構造安定性とは、タンパク質が特定の機能的な構造をどれだけ保ちやすいかを示す指標で、機能を示すタンパク質分子の割合を規定するため、非常に重要な性質の1つです。今までは、一
AI開発の新たなパラダイム「基盤モデル」とは
さて、視覚・言語を扱う基盤モデルとしては、2021年の CLIP がブレイクスルーでした。CLIPはテキストと画像を同じ特徴空間に写像する2つのエンコーダからなります。CLIPを使うと、次のようにして任意の画像分類問題を追加の学習なしで解くことができます。まず、各候補クラスを文章の形式（例：「犬の写真」）にした後、テキストエンコーダに入力します。次に、分類したい画像を画像エンコーダに入力します。最後に、画像から得られたベクトルと候補クラスたちから得られた複数のベクトルとのコサイン類似度を計算し、最も類似度が高いクラスを出力結果とします。 CLIPによるゼロショット画像分類の方法。OpenAI Blogより引用 CLIPは画像とテキストというモードの異なる情報を意味的な近さによって結びつけることを可能にしました。CLIPを教師のようにして使うことで、テキストから画像を生成するモデルを訓練する
脊髄小脳変性症治療薬「ロバチレリン（KPS-0373）」の国内製造販売承認申請取り下げのお知らせ | キッセイ薬品工業株式会社
キッセイ薬品工業株式会社（本社：長野県松本市、代表取締役会長兼最高経営責任者：神澤陸雄）は、このたび、脊髄小脳変性症治療薬「ロバチレリン」（一般名、開発番号：KPS-0373）について、今後の開発方針を検討するために、日本国内における製造販売承認申請を取り下げたことをお知らせします。 当社は、これまでに実施した2つの第Ⅲ相臨床試験ならびに併合解析の結果から、国際的に用いられているSARAスコアにより、脊髄小脳変性症における運動失調に対して初めて改善効果が検証された薬剤であると判断し、2021年12月22日に製造販売承認申請を行いました1。しかし、今般、医薬品医療機器総合機構（以下、PMDA）より、現状の臨床試験データでの承認は困難であるとの見解が示されたことから、一旦、承認申請を取り下げ、追加臨床試験の実施可能性などについてPMDAと協議することとしたものです。 なお、本件の今期業績に与え
The Next Frontier For Large Language Models Is Biology
A protein’s shape relates closely to its function. To take one example, antibody proteins fold into shapes that enable them to precisely identify and target foreign bodies, like a key fitting into a lock. As another example, enzymes—proteins that speed up biochemical reactions—are specifically shaped to bind with particular molecules and thus catalyze particular reactions. Understanding the shapes
鎖国時代に生きた葛飾北斎が「世界のアート界」を席巻するまで | 世界で一番有名な「波」を描いた江戸のアーティスト
現在、ボストン美術館で日本の版画と世界の現代アートの展覧会「北斎──インスピレーションと影響」が開催中だ。それを受けて、米「ニューヨーク・タイムズ」紙の批評家が、江戸時代の北斎が西欧の芸術界に与えた影響を解説する。 ヨーロッパの現代文化に最も影響を与えた人物のひとりは、ヨーロッパに一度も足を踏み入れたことがなかった。葛飾北斎は、鎖国をしていた江戸時代の庶民が皆そうであったように、望んだとしても日本列島から出て行くことはできなかったし、彼の版元も歌舞伎役者や花、富士山を描いた彼の版画を輸出することはできなかった。 だが1849年の北斎の死から数年後、マシュー・ペリー代将率いる黒船がいまの東京湾に来航したとき、日本の通商は強制的に開かれ、彼の木版画が海を越えて、はたはたと飛んで行くようになった。フランスに、英国に、そしてまもなく米国に、まったく新しい種類の芸術が出現することになる。そして日本で
コラム53：迷惑はかけてもいい｜運営委員・相談員のコラム｜学習相談室｜東京大学大学院法学政治学研究科・法学部
コラム53：迷惑はかけてもいい 日本人ならたいてい子どものころから、親や学校の先生などから、「他人に迷惑をかけてはいけません」と言われて育ってきたのではないだろうか。そのため、「他人に迷惑をかけてはいけない」というのは、普遍的な道徳律だと思っている人も多いのではないかと思う。私も数年前までそう思っていた一人だった。しかし、どうやらこの教えはそれほど普遍的な規範とは言えないようだ。日本語教師をしている私の知人によれば、中国ではこのような規範を子どもに教える親はほとんどいない代わりに、「困っている人を助けなさい」と教える親が多いという。私の友人の韓国人によれば、韓国でも「他人に迷惑をかけるな」という人はいるものの、日本ほど多くはないという。むろん、日本でも「困っている人を助けなさい」と教える親もいるだろうが、「他人様に迷惑をかけてはいけない」と教える親に比べると、圧倒的に少数派だろう。 新約聖
逆転写酵素がDNA合成を促進することを示す画期的な論文/バイオクイックニュース - バイオマーケットjp/バイオクイックニュース
ソルナック チューブの使用例 【CFANを用いたリン酸塩緩衝液でのLC/MS測定】 UVクロマトグラフの時間軸に沿った形で、トータルイオン電流（TIC）クロマトグラフ及び抽出イオンクロマトグラフが得られます。 【OOANを用いたNa付加イオンの除去】 サセックス大学（英国）のAidan Doherty教授率いる研究チームが、Nucleic Acids Research（NAR）誌の "Breakthrough Article"で驚くべき成果を発表しました。彼らの研究では、CRISPRに関連する逆転写酵素（RT）がDNA合成のプライミングをRNAとDNAの両方で直接行うことが明らかにされ、さらにこのRT依存性のプライミングがいくつかのCRISPR-Cas複合体によって利用され、新しいスペーサーが合成され、CRISPRアレイに統合されることが示されました。 この重要な研究では、グループIIのイ
“医師不合格”の石碑 だれが？なんのため？ 岩手・一関 | NHK
笑ってしまった。 合格でも変だが、「不合格」を碑にした人がいるとは。 いったいなぜこんなことをしたのか。 「松井元哉さん」にどうしても会いたい。私は、それまで職場には戻らないと宣言し、取材を始めた。 2023年7月6日「おばんですいわて」で放送 人気のない場所にぽつん インターネットの情報を頼りに、まずは現場へ。 岩手県南部、一関市の中心部から車で20分。人気のない道路脇の林の陰に、それはあった。 高さは1メートル、厚さは2センチほどで、ずいぶんスマートだ。 「松井元哉 第113回医師国家試験 不合格発表閲覧之地」。 間違いない。黒地に、白い文字が目立つ。これを素直に信じれば、松井さんという人が、ここで、医師国家試験の不合格の知らせを受け取った、ということになる。 石碑は人気のない道路脇に建っていた 写真を撮っていると、林からガサガサと音がした。 まさか、松井さんにいきなり遭遇！？ 石碑の
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Autoencoder-transformed transcriptome improves genotype-phenotype association studies
https://www.cs.cmu.edu/~jianma/talks/LLM-CGSI-slides-public.pdf00675-X)
Functional viromic screens uncover regulatory RNA elements
https://www.science.org/content/blog-post/protein-design-ai-way
Mega-scale experimental analysis of protein folding stability in biology and design - Nature
AI tools are designing entirely new proteins that could transform medicine
DeepTraSynergy: drug combinations using multimodal deep learning with transformers
https://www.city.shimotsuma.lg.jp/sp/page/page002675.html
熱海「ホテルニューアカオ」が復活！ 昭和レトロな館内に、海の絶景を一望できる温泉大浴場や海鮮いっぱいバイキング
Distinguishing word identity and sequence context in DNA language models
RNAGEN: A generative adversarial network-based model to generate synthetic RNA sequences to target proteins
UNI-RNA: UNIVERSAL PRE-TRAINED MODELS REVOLUTIONIZE RNA RESEARCH