Introduction to Bioinformatics
バイオインフォマティクス入門コース 理論分子生物学（京都大学理学部）講義資料 ゲノム解析とポストゲノム解析 （参考資料）ヒューマンゲノム計画とニューバイオフィジックス データベース技術とインターネット （参考資料）ゲノムネットのデータベースサービス概要 分子生物学データベース （課題1）データベース検索（DBGET/LinkDB, PubMed） （課題2）タンパク質立体構造グラフィックス（RasMol, Chime） 配列アライメントとホモロジー検索 （課題3）ホモロジー検索（FASTA, BLAST） （課題4）マルチプルアライメント（CLUSTALW） （資料）式一覧 構造予測と機能予測 （課題5）モチーフ検索（MOTIF, PFAM） （課題6）タンパク質二次構造予測、膜貫通部位予測（nnpredict, SOSUI） （課題7）タンパク質立体構造分類（SCOP, CATH） ネ
2018年 プレスリリース - 東京大学 大学院理学系研究科・理学部
12/17 赤外線天文衛星「あかり」、小惑星に水を発見 12/17 第二の地球を発見するための新しい多色同時撮像カメラMuSCAT2が完成 12/12 結晶質岩（花崗岩）内の割れ目評価のための新知見 12/01 世界最古の水稲栽培文明を滅ぼした急激な寒冷化イベント 11/30 超巨大ブラックホールを取り巻くドーナツ構造の正体を暴く 11/23 メチルは端だが役に立つ？ 11/22 高圧下における水素結合の対称化の直接観察に成功 11/09 受精時にホヤ精子が誘引物質を受容する機構を解明 10/29 長すぎるアルコールが生物に作用しない原因を解明 10/25 光を巧みに操ることで新しい分子分光法の開発に成功 10/22 カーボンナノチューブの新展開：水中で働く不斉触媒の高機能化を実現 10/12 潮の満ち引きと気候を繋ぐメカニズムをシミュレーションで解明 10/05 “退屈な10億年”は飢え
変換効率最高水準の太陽電池 産総研（フジサンケイ ビジネスアイ） - Yahoo!ニュース
産業技術総合研究所は、光エネルギーを電気エネルギーに直接変換する効率「光電変換効率」を世界最高水準の１５．９％まで引き上げることに成功した。携帯情報端末などの分野への応用が期待される薄型太陽電池「ＣＩＧＳ薄膜」型で高効率を達成したもので、太陽光発電の可能性を広げる一歩となる。 産総研は、１枚のセラミック基板上に集積回路のように太陽電池を集積する構造をした短冊状のＣＩＧＳ薄膜モジュールを作製し、今回の高い効率を達成。同薄膜は軽くて曲げることが可能な太陽電池として注目されていたが、１０％以上の効率を得ることが難しかった。産総研は今回、高効率化に必要な各種の課題をクリアした。 【関連記事】 ・ 京セラ 米に初の生産拠点 太陽電池 成長市場で先行狙う ・ 三洋電機「ソーラーＬＥＤ街路灯」 リチウムイオン 蓄電量３倍 ・ 三菱電機、太陽電池開発 多結晶で世界最高の発電効率 ・ グーグル、
地球から人類が消えても永遠に残るもの
人類が消えてから… 2日後 水の汲み上げがストップすることにより、ニューヨークの地下鉄は完全に水浸しになる。 7日後 原子炉の冷却水を循環させる発電機の非常用燃料が尽きる… 1年後 電波塔の警告ランプの点滅や、高圧線の電流が止まる。 これにより今まで世界で何十億羽と死んでいた鳥たちが死ななくなる。 燃え尽きた原子炉の周囲に、動物たちが戻ってくる。 3年後 暖房熱が失われた寒冷地では、とうとう水道管が破裂しはじめる。 収縮・膨張を繰りかえした建築物はきしみが出るようになり、屋根と壁の間に隙間ができる。 暖房の無くなった寒冷地では、冬を1〜2度越すとゴキブリが全滅してしまう。 20年後 10年前に雨漏りが始まっていた屋根は、もうすでに消えている。 100年後 線路や道路を支える鉄柱が腐食し、湾曲する。 パナマ運河が埋まっていき、大陸が再結合しはじめる。 野菜は味の悪い野生の品種に戻っていく。
メダルはなぜ金銀銅か|ガジェット通信 GetNews
オリンピックの中継を観ていて寝不足になってしまっている人も多いのではないでしょうか。3種類のメダルを目指し世界のアスリートたちが競い合っています。今回はそのメダルの素材について佐藤健太郎さんのブログ『有機化学美術館・分館』からご寄稿いただきました。 メダルはなぜ金銀銅か バンクーバーオリンピックがたけなわ、昨日（編集部注：記事執筆当時）は日本選手が今大会初のメダル獲得ということで、今日はこの辺の話題で書いてみましょう。 現在ではオリンピックの3位までの入賞者に金・銀・銅のメダルが贈られることはすっかり定着していますが、近代五輪開始当初はそうではなかったようです。第1回アテネ大会（1896年）では財政難などもあって1位に銀メダル、2位に銅メダルが与えられただけで、3位以下には何もありませんでした。第2回パリ大会では陸上競技のみに金・銀・銅メダルが贈られたものの、製作が間に合わず本人の元に届い
今までで最も精緻な高解像度地球画像
これ、今までで最も精緻な、高解像度の地球の画像だそうです。 NASA提供。 美しい...しかも上の地球は実はサムネイル。クリックすると2048×2048の大きさの画像が出てきますので、壁紙になさってください。 真ん中にあるのはインド辺りですね。ちょうど反対側の画像は以下に。
＜ｉＰＳ細胞＞遺伝子やウイルス使わずに作成 米大が成功（毎日新聞） - Yahoo!ニュース
遺伝子やウイルスを使わずに医薬品を投与して、がん細胞のもとからヒト人工多能性幹細胞（ｉＰＳ細胞）を作ることに、米ハーバード大の森口尚史研究員らが成功した。医薬品の投与のみで作成したのは初めて。ウイルスが細胞内にある遺伝子を傷つけるなどの弊害を回避できる可能性がある。２３日、東京都で開催中の国際会議で発表した。また、大学は特許出願の手続きを始めた。 ｉＰＳ細胞はさまざまな細胞になるが、がん化が課題になっている。チームはその仕組みを探る一環で、肝がん細胞の元である「肝がん幹細胞」に、２種類の抗がん剤の新薬候補物質を加えたところ、２日後にはほぼ正常な肝細胞に変化することに気付いた。 また、この肝細胞に、山中伸弥・京都大教授が発見した遺伝子の働きを活性化させる別の抗がん剤４種類を４日間投与すると、２週間後にｉＰＳ細胞ができることを発見した。 元の肝がん幹細胞は多くの染色体に異常があったが、ｉ
お湯が水より速く凍結？ 動画と説明 | WIRED VISION
前の記事 空飛ぶパンツが秋葉原で飛び交う日 貸与されたノートPCが「盗撮」？：米国学校区が提訴される 次の記事 お湯が水より速く凍結？ 動画と説明 2010年2月23日 サイエンス・テクノロジー コメント： トラックバック (0) フィードサイエンス・テクノロジー Kathy Ceceri 真冬にできる楽しい実験がある。 1,華氏0度[摂氏マイナス18度]より低いことが望ましい。 2,協力的な子供を準備し、沸騰したお湯のカップを渡す。 3,空中にお湯を投げてもらってそれを撮影する。 われわれの実験はリンク先の動画だが、もっとドラマチックな動画を以下に掲載する。[カナダのサスカチュワン州で撮影。摂氏マイナス40度の環境だという] しばらく検索してみたあとで、この現象がなぜ起こるかというわかりやすい説明を見つけた。ロサンゼルスのRockwell Science CenterにいるJoe Lar
『「ＤＮＡテレパシー」について』
最近の研究で、人間の体内にあるＤＮＡは、 何らかの方法で互いに連絡をとりあっているということがわかりました。 研究者によればＤＮＡには 「体内の離れた距離にある自分自身に似たＤＮＡを集める奇怪な能力があり、どう考えてもテレパシーか精神感応力のようなものを使って互いの情報を交換しているとしか思えない」 とのことです。 つまり、僕らのＤＮＡはテレパシーを使えるということらしいのです。 これだけを聞かされても『ふ～ん…』と思う人が大半だと思いますが、今回は一歩踏み込んで、 『個人の体内だけではなく、他人同士のＤＮＡでも情報を交換し合える』 という仮説を立ててみることにします。 よく、初対面でも『気が合いそうなだな』と感じたりすることがあります。 『全身から怒りのオーラが漂っていた』なんてのもよく聞きますね。 科学者でも説明がつかないこれらの現象も、 この仮説を定説として考えれば説明がついてしまう
【書評】『ガンは治るガンは治せる―生命の自然治癒力』の感想－JanJanニュース
【書評】『ガンは治るガンは治せる―生命の自然治癒力』の感想 2010年02月21日今週の本棚 熊木秀夫 この本のカバーに印刷された「生命の自然治癒力」を見て思った。自然治癒力は、すべての生物が持っているものだと。 ずっと以前、私の家でもネコを飼っていた。そのネコは喉に穴が開く病気になった。医者に連れて行くかどうするか家族で話しているとき、ネコは水草のためにみどり色になった金魚鉢の水をしきりに飲んでいた。 ネコがその水を飲みやすいように周りを片付けておくと、あまり頻繁に、金魚鉢に近づかなくなった。見ると喉の傷口はふさがれていて、病気は治ったのだ。私はこれを見て自然治癒力が人間だけでなく、生命をもつすべての動物にあると確信した。 建設現場で、木の梁を担いでいる時、足を滑らせて、躓き、梁の角が胸に当たった。時間が経つに従い、うずくような痛みを感じて、医者に見てもらうと肋骨が折れていることが
NIKKEI いきいき健康
「いきいき健康」をご愛読いただきありがとうございます。 当サイトは、2011年12月26日をもちまして終了いたしました。皆様には長らくご愛顧いただき、誠にありがとうございました。 健康関連の情報については、日本経済新聞 電子版・ライフコーナーの「ヘルス」をご覧ください。
４兆度！に成功、「ビッグバン」直後を再現 : ニュース : 宇宙 : YOMIURI ONLINE（読売新聞）
現在の宇宙のなかで最も熱い４兆度という超高温状態をつくり出すことに、理化学研究所や東京大、米ブルックヘブン国立研究所などの研究チームが成功した。 宇宙が始まった「ビッグバン」から１００万分の１秒後の状態を再現したと考えられ、宇宙進化を解明する手がかりになると期待される。米ワシントンで開かれる米国物理学会で１５日に発表する。 研究チームはブルックヘブン研究所の施設（加速器）で、金の原子核同士を光速に近いスピードで衝突させた。衝突で生じる膨大なエネルギーによって、周辺には、物質を構成する究極の素粒子「クォーク」などが液体のように広がる状態が発生した。 この時発せられた光の強さを分析したところ、衝突時の温度が４兆度に上ることがわかった。太陽の中心部の２５万倍高い温度で、現在の自然状態の宇宙には存在しない温度と考えられる。 研究に参加する東京大の浜垣秀樹准教授は「超高温状態を調べることで、宇宙進化
asahi.com（朝日新聞社）：研究費の無駄、けっこうありました 仕分け受け若手調査 - 社会
裕福な研究室では高額顕微鏡を１〜２年ごとに買い替え、型落ちになった機器は使われずに放置――。こんな研究室での無駄の実態が若手研究者らのまとめで分かった。行政刷新会議の事業仕分けでの厳しい指摘を受けて実態を反省、科学技術研究の強化をめざした提言をまとめた。 まとめたのは約１５００人が参加する神経科学者組織の有志。約１７０人が回答したアンケートでは、９割が研究費の仕組みや使い方に無駄があると指摘した。 問題点として、年度末には「研究費を全部使い切るように事務から強い指導がくる」「不要な物品や高額機器を購入することも多々ある」。「輸入機器は中間マージンで現地価格の２〜３倍、場合によっては４倍近い値段」などがあった。 解決策として、実際に研究をする若手も加わった研究者組織を作り、開かれた議論によって無駄の排除と効率化を進める一方、重要な研究予算は削らないしくみが必要と指摘。複数年度にまたがっ
CNN.co.jp：「植物状態」の患者に意識あり 脳スキャンで判明と
ロンドン（ＣＮＮ） 植物状態と診断された患者らに質問を投げ掛け、脳の反応を機能的磁気共鳴画像法（ｆＭＲＩ）で調べる研究で、一部の患者に意識のある兆候が見られた。英ケンブリッジ大とベルギー・リエージュ大の研究者による共同チームが４日、研究の成果を発表した。 チームは３年間にわたり、植物状態にあるとされる患者２３人を対象に研究を実施。「あなたのお父さんの名前はトーマスですか」など、「はい」「いいえ」で答えられる項目を尋ね、ｆＭＲＩで脳の活動の変化をみた。 健常者の脳をこの方法で調べた場合、質問に対する答えと１００％一致する反応が得られる。チームの研究では、全体の１７％に当たる４人の患者が、質問に反応を示したという。 特に、２９歳のベルギー人男性の脳からは、はっきりと「はい」「いいえ」に相当する変化が読み取れた。この男性は２００３年の交通事故で頭部に重傷を負い、こん睡状態に。外界との交流が一切途
SciencePortal | 科学技術の最新情報を提供する総合WEBサイト サイエンスポータル
3月28日 農業は地球の環境悪化の緩和に重要な役割を果たす フランス農学・獣医学・林学研究院 アグリニウム会長 マリオン・ギュー 氏 3月8日 近未来SF漫画で描かれるテクノロジーの未来 漫画家 山田胡瓜さん 12月28日 「世界中の望遠鏡が協力して中性子星合体を観測 ―重力波と光の同時観測『マルチメッセンジャー天文学』の幕開けは、何を意味するのか?」 理化学研究所仁科加速器研究センター 玉川 徹 氏 4月20日 《JST主催》『女性研究者と共に創る未来』公開シンポジウムを開催 「科学と社会」推進部 4月13日 《JST共催》『ひかり×ひと』－『情報ひろばサイエンスカフェ』で大学院生と中高生らが語り合う 「科学と社会」推進部 4月10日 「持続可能な食の未来へ」をテーマに「ノーベル・プライズ・ダイアログ東京2018」開催 世界中からの食の専門家が集結 「科学と社会」推進部 4月11日 信頼
Hisタグ - Wikipedia
Hisタグ（ヒスタグ、ヒスチジンタグ）は、6個程度の連続するヒスチジン (His) 残基からなるタグペプチドの一種であり、通常は遺伝子工学的に産生したタンパク質を固定化金属イオンアフィニティクロマトグラフィーによって精製する際に用いられる。His・Tagはドイツのメルク社の登録商標である。 一般にタンパク質はその表面で金属イオンを配位する性質を多少なりとも持っており、その親和性の差を利用したクロマトグラフィーによってタンパク質を分離することが可能である。これが1975年に発表された固定化金属イオンアフィニティクロマトグラフィーである[1]。その後の研究で、タンパク質を構成するアミノ酸のうち、特にヒスチジンが金属イオンとの配位結合に強く関わっていることがわかってきた[2]。そこで遺伝子工学によりタンパク質の末端にヒスチジンを多数付加すれば、そのタンパク質の金属イオンに対する親和性が著しく増大
http://kitaori.net/download.htm
このページでは北折研究室の学生が作ったパワーポイントテンプレートや化学実験器具の画像などをアップしています。 是非、研究のお役に立てて下さい。 東京高専のロゴが入った非公式パワーポイント・テンプレートです。 画像をクリックするとzip形式でダウンロードできます。 赤バージョン 青バージョン 黒バージョン 緑バージョン 橙色バージョン ※ パワーポイント2003へのデザインテンプレートの適用方法 1. ダウンロードしたzipファイルを解凍する。 （解凍方法については各自調べて下さい） 2. Power Point 2003を起動する。 3. Fig. 1 に示されるデザインボタンをクリック。 （環境によっては表示されない場合があります） 4. Fig. 2に示される画面右下の参照
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https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp7112297
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