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Avogadro
Avogadro is an advanced molecular editor designed for cross-platform use in computational chemist... Avogadro is an advanced molecular editor designed for cross-platform use in computational chemistry, molecular modeling, bioinformatics, materials science, and related areas. It offers flexible rendering and a powerful plugin architecture. Cross-Platform: Molecular builder/editor for Windows, Linux, and Mac OS X. Free, Open Source: Easy to install and all source code is available under the GNU GPL
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