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AWS ParallelCluster で Apptainer を利用して Trinity を実行してみた | DevelopersIO
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RNA-Seq データのアセンブルで有名な Trinity を AWS ParallelCluster 上で Apptainer を用いて Trinity... RNA-Seq データのアセンブルで有名な Trinity を AWS ParallelCluster 上で Apptainer を用いて Trinity コンテナを実行する方法を紹介します。 Trinity コンテナイメージはどちらを使うか Trinity のセットアップは、公式に提供されているコンテナイメージを利用して手間取る環境構築を省略する方針とします。 現在、Trinity のコンテナイメージは OCI 形式と SIF 形式 の 2 種類提供されています。 OCI 形式はコンテナ技術の標準化を目指す Open Container Initiative (OCI) が定義したコンテナイメージのファイル形式です。 SIF 形式 (Singularity Image Format): Apptainer (旧 Singularity) で使用されるコンテナイメージのファイル形式です。