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ADMIXTUREの図はどう見るか? - 知識探偵クエビコ
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ADMIXTUREの図はどう見るか? - 知識探偵クエビコ
予告とは違うが、ADMIXTUREの解析の図が登場してくるし、やっぱりまとまった説明が必要らしい。以前から... 予告とは違うが、ADMIXTUREの解析の図が登場してくるし、やっぱりまとまった説明が必要らしい。以前からやるべきかと思っていたし、自分に理解のできた範囲でだが、説明を書いておこう。 まず最初に、ADMIXTUREとは何か? 集団をいくつかの近似した部分ごとに切り分ける解析――クラスタ解析(Cluster analysis*1。いろいろな対象に使われる。遺伝人類学の場合はHuman genetic clustering)――をするとき使う、遺伝学用のツールの一つが、ADMIXTURE(公式)だ。 分割数Kについても説明しておこう。 k平均法(k-means clustering(画像解析の話もある)。マーケティングに関する日本語サイトでの解説)などが、このKの元にある。(感覚的なイメージとしては、減色して画像の意味を判断する画像解析なども参考になる) ――マーケティングサイトのリンク先から