遺伝子発現データを使用した機械学習 - Qiita

(2017.02.02 OSX El Capitan) 様々なヒト組織から取られた遺伝子発現データを使用して、遺伝子発現プロファイルから、 各々のサンプルが、どのヒト組織由来であるかを学習＆推論してみます。 Python 機械学習プログラミング を参考に実行してみました。 機械学習用遺伝子発現データの準備 GTEx Portal からデータを取得 GTEx Portal では、ヒトの様々な組織由来の遺伝子発現データが公開されています。 最新の GTEx Analysis V6p Release では、53 のヒト組織、544 のドナーから、 合計 8555 サンプルの遺伝子発現データが取得できます。 サイトにアカウント登録をすることで、遺伝子発現データをダウンロードできるようになります。 サイトのナビゲーションバーの Datasets -> Download から行けるページにダウンロード