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Rで系統樹を扱う(ape, ggtree) - Qiita
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Rで系統樹を扱うときに必要なapeやggtreeの使い方がどうしても覚えられないので軽くまとめました。 内容... Rで系統樹を扱うときに必要なapeやggtreeの使い方がどうしても覚えられないので軽くまとめました。 内容については随時追加予定です。 参考にしたサイト ggtree: Elegant Graphics for Phylogenetic Tree Visualization and Annotation facet_plotの記事 Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Trees 4, 7章あたり (そのまま4章に飛びます) Visualizing and Annotating Phylogenetic Trees with R+ggtree 系統樹データについて treeオブジェクトの中身 treeの中には、大体以下の5つのデータが格納されています。 edge:どのノードとノードが繋がっているか