メタゲノムアセンブリ

微生物は生物多様性の多くの部分を占めていますが、生息環境が多様であることからそれらの多くは培養することができず、従来の培養を経たゲノム解析で得られる知見は限られています。メタゲノム解析とは培養に依存することなく網羅的に微生物のゲノムを解析する手法であり、培養することができない微生物種について多くの知見をもたらしています。 メタゲノムプロジェクトは解析段階に応じたいくつかのデータから構成されており、アセンブリ段階に応じて四つに区分されます。 (1) アセンブル前の NGS 生リード (2) 分類群が未同定のアセンブルされたコンティグ配列（プライマリーメタゲノム） (3) Binning され既知の分類群に帰属されたアセンブリ配列（Binned メタゲノム） (4) 単一の分類群に帰属された Binned アセンブリ配列の中で、分類群を代表する、配列の完成度・コンタミネーション割合といった指標