世界中で警戒が強められている新型コロナウイルスの新しい変異株「オミクロン」。 大阪や京都府で市中感染が確認され、いよいよ日本でも広がりが加速することを覚悟しなければならなくなった。 一方で、忘年会で飲食店はどこもいっぱいで、これから年末にかけて帰省や旅行を考えている人も多い。ワクチンの効果も薄れ始めている中、私たちは今、オミクロンにどう向き合えばいいのだろう。 BuzzFeed Japan Medicalは、京都大学大学院医学研究科教授の理論疫学者、西浦博さんにオミクロンを専門家はどう見ているのか、聞いた。 ※インタビューは12月23日に行い、その時点の情報に基づいている。 専門家と一般の危機意識に大きなギャップーー久しぶりですが、西浦先生がメディアに出る時は危機が迫っている時だという印象があります。 2回の予防接種が高い接種率で完了して効いている状態で、しばらく平和だったからですね。この
Hiroshi Nishiura on Twitter: "東京都の先週今週比は実効再生産数より少しオーバーな値を与える便利指標。先週に高くて7月26日に1.96、27日2.05、28日1.73、29日1.95と続き、30日2.43、31日3.59。どこまで伸びるのかと思い見ていました。し… https://t.co/aiYXQWYeIg"
東京都の先週今週比は実効再生産数より少しオーバーな値を与える便利指標。先週に高くて7月26日に1.96、27日2.05、28日1.73、29日1.95と続き、30日2.43、31日3.59。どこまで伸びるのかと思い見ていました。し… https://t.co/aiYXQWYeIg
新型コロナウイルスの感染拡大の対策を短期的に集中的に行う「勝負の3週間」の感染状況について、NHKは疫学の専門家の監修のもとで、感染の状況を見る指標で、1人の感染者から何人に感染が広がるかを示す「実効再生産数」を、簡易な方法で出して分析しました。 全国での実効再生産数は「勝負の3週間」の呼びかけの後も、感染が拡大に向かう「1」を超える状態が続いていることがわかり、感染症の専門家は「効果は出ていないように見え、より強い対策を取る必要がある」としています。 NHKは疫学の専門家で、国立感染症研究所鈴木基感染症疫学センター長の監修を受けて、1人の感染者が何人に広がるかを示す「実効再生産数」を、簡易な方法で計算しました。 実効再生産数をより正確に出すためには、発症日を推定して計算するなど、さらに多くの条件を考慮する必要がありますが、今回は確認された日ごとの感染者の数をもとに、簡易な方法で計算してい
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緊急事態宣言が出されてから22日で2週間になります。緊急事態宣言の対象地域となっている11都府県について、NHKが1人の感染者から何人に感染が広がるかを示す「実効再生産数」を簡易な手法で計算したところ、多くの都府県で前の週より低くなっていることが分かりました。専門家は「減少傾向にあるのはよい兆しだが非常に微妙な状況で、今が頑張りどころだ」と指摘しています。 実効再生産数は、「1」を上回ると感染が拡大に向かう一方、「1」を下回ると収束に向かうとされ、感染状況をみる指標となりますが、発症日をもとに計算するなど、多くの条件を考慮する必要があるため、正確な数値が出るまでに時間がかかります。 このため、NHKは疫学の専門家で国立感染症研究所の鈴木基感染症疫学センター長の監修を受け、緊急事態宣言が出ている11都府県について、21日までのデータに基づいて毎日、報告される感染者数を基に簡易な手法で目安とな
緊急事態宣言が出されてから15日で1週間になります。今週から新たに対象地域となった7府県を加えた11都府県について、NHKが感染状況を見る指標で、1人の感染者から何人に感染が広がるかを示す「実効再生産数」を専門家に監修を受けた簡易な方法で計算しました。11都府県すべてで感染が拡大に向かうことを示す「1」を上回っていて、拡大のペースが上がっている地域も見られます。 NHKは、疫学の専門家で国立感染症研究所の鈴木基感染症疫学センター長の監修を受けて、簡易な方法で、緊急事態宣言が出ている11都府県について、14日までのデータに基づいて、実効再生産数を計算しました。 実効再生産数は、「1」を上回ると感染が拡大に向かう一方、「1」を下回ると収束に向かうとされていて、より正確に出すためには、発症日を推定して計算するなど、さらに多くの条件を考慮する必要がありますが、時間がかかるため、確認された日ごとの感
運動した医 on Twitter: "陽性率は20%代をキープです。事前確率の高い層にしか検査が届いて無い証拠であり、無症候感染者を大量に取りこぼしている可能性が高いです。いわゆる、サチってるってヤツです。 その状況下での実効再生産数って、アテになるとお考えですか？ https://t.co/shBkqNAmxf"
陽性率は20%代をキープです。事前確率の高い層にしか検査が届いて無い証拠であり、無症候感染者を大量に取りこぼしている可能性が高いです。いわゆる、サチってるってヤツです。 その状況下での実効再生産数って、アテになるとお考えですか？ https://t.co/shBkqNAmxf
これはぴったり一致している。凄い。 なおタイトルに札幌とありますが、正確には石狩振興局管内と所在非公表のデータになります。また、札幌の感染者数は北海道全体の7割くらいです。
Hiroshi Nishiura on Twitter: "知事に教えた方は解釈のレク、ちゃんとやったんでしょうねえ？こんな言及のやり方をしたら政治的議論ばかり先に進んでしまうが、皮肉にも皆が実効再生産数Rtについて知りたいと思う良い機会なのだから、皆でRtの中身を理解して前に一歩進むしか… https://t.co/CUzsCrfWwM"
知事に教えた方は解釈のレク、ちゃんとやったんでしょうねえ？こんな言及のやり方をしたら政治的議論ばかり先に進んでしまうが、皮肉にも皆が実効再生産数Rtについて知りたいと思う良い機会なのだから、皆でRtの中身を理解して前に一歩進むしか… https://t.co/CUzsCrfWwM
ついに新型コロナの第３波襲来か――。各地でクラスターが相次いでいる。 千葉ロッテは６日、角中勝也外野手、鳥谷敬内野手らチーム関係者１１人の陽性を発表した。 札幌のススキノのクラブでも５日、２３人のクラスターが発生。陸自朝霞駐屯地での教育課程に参加していた隊員３１… この記事は有料会員限定です。 日刊ゲンダイDIGITALに有料会員登録すると続きをお読みいただけます。 (残り762文字／全文902文字) ログインして読む 【ログインしていただくと記事中の広告が非表示になります】
新型コロナ「経済と感染制御」ドイツは実効再生産数（Rt）=0.75を目指し、東京は数値目標を撤廃して感染拡大を放置した - 踊る小児科医のblog
It is no use crying over spilt milk 覆水盆に返らず 高校に入ったときに最初に習った英語の格言の一つですが、もしかしたら本当の最初は Cool as a Cucumber だったか。。 いま思うと、どちらも単に英語を教えるだけでなく、何か心の片隅に残って、活かされていくことを期待していたのかもしれない。。（キュウリを食べると思い出します） ６月末にNHKで放映された２本の特集番組で、いずれもドイツの経済学者と感染症学者の共同研究が紹介されていました。 BS1スペシャル「新型コロナウイルス 世界は科学で闘った」2020年6月29日放送 NHKスペシャル「新型コロナウイルス 危機は繰り返されるのか」2020年7月2日放送 GDPの損失は、Rt=0.1（厳しいロックダウン）でもRt=1.0（感染持続）でもなく、Rt=0.75のときに最も少なく抑えられる。 これは
普段は買い物客などでにぎわうが、厳しい行動規制を受けて閑散とするオックスフォード通り＝ロンドンで2020年12月23日、AP 英国で感染が拡大している新型コロナウイルスの変異株について、1人の感染者が他人にうつす平均人数を表す「実効再生産数」（R）を最大で0・7押し上げる可能性があるとの調査結果が出た。インペリアルカレッジ・ロンドンの研究チームの調査で判明した。ロックダウン（都市封鎖）の間でさえも感染が広がっているとみられ、変異株の感染力の強さを裏付けているといえそうだ。 ロンドンとイングランド南東部で2020年9月に確認された変異株はその後、感染が拡大し、ロンドンでは12月中旬に新規感染者の62％を占めるようになった。 変異株は従来株に比べ、重症化率が高くなるとの証拠はない。しかし、感染力の強さが指摘され、英政府は「従来株より最大で7割強まっている」とし、Rについても0・4引き上げる可能
竜田一人 on Twitter: "東京の実効再生産数、1を切ってるんですが、あんまり話題になってませんねー。なんだかんだいろいろあったけど、みんな頑張ってきた結果は着実に出てきてますよ。 https://t.co/ANMyAP7lYl"
東京の実効再生産数、1を切ってるんですが、あんまり話題になってませんねー。なんだかんだいろいろあったけど、みんな頑張ってきた結果は着実に出てきてますよ。 https://t.co/ANMyAP7lYl
Philippe Lemoineというコーネルの博士課程にいる研究者が、自らが所属するThe Center for the Study of Partisanship and Ideology（CSPI）という組織のブログに「Have we been thinking about the pandemic wrong? The effect of population structure on transmission」と題した長文のエントリを上げ、タイラー・コーエンが「Why does R vary so much in pandemics?」というコメントを添えて リンクしている。Lemoineはツイートでその内容を解説しているので、以下にその一部を引用してみる。 However, as I argue in the post, I think it's very difficult
COVID-19感染報告者数に基づく簡易実効再生産数推定方法
はじめに 実効再生産数（effective reproduction number: Rt）は「（ある時刻tにおける, 一定の対策下での）1人の感染者による二次感染者数」と定義され1）, 現在流行が拡大期にあるのか収束に向かっているのかを評価する疫学指標の1つとして重要である。2019年末からの新型コロナウイルス感染症（COVID-19）の流行に際しては, 世界各国・地域で流行状況を評価する指標として活用されている。しかし厳密なRtの計算には数学に関する知識やプログラミングの技術を必要とすることから, 必ずしもそうした技能を有する人材がいるとは限らない現場での活用は進んでいない。本稿では, 高度な専門知識を要さずに日ごとのCOVID-19陽性者数を使って簡便にRtの近似値を算出する方法を紹介し, その精度を検討した。 方 法 Rtを推定する時の最も簡潔な考え方は, ある時刻における感染者数
2020年9月21日 水野義之（京都女子大学） 要旨： 本稿では、新型コロナウイルスの感染者数が、一度増加に転じた後、ピークアウトする時期を予測するための、簡便な方法について解説する。この方法は統計誤差が小さいことが必要である。このため大都市圏など感染者数が多い場合に使うことができる。事例として2020年8月のピークアウトの予測を東京都、大阪府、神奈川県の場合に、約２週間前にできることを示した。 ただし今後、本稿で想定していない社会変動やメディアの報道姿勢の変化（例えば日本のマスメディアも実効再生産数Rを報道する等）、あるいは国民の行動変容の考え方の変化、等が起こる可能性もある。その場合は本稿の方法は使えない可能性がある。しかし本稿で解説した考え方は、おそらく一部を変更して使える可能性もあることに注意したい。 １．はじめに：感染者数の増加とマスメディア 1.1 感染者の増え方のパターン 2
実効再生産数ってなに？ | 済生会
連日報道される新型コロナの感染状況。記事の中では、普段聞きなれない専門用語も多く出てきます。また、日々発表される感染者数やPCR検査数といったデータも、それから何が分かるのか知らなければ、ただ数の大小に振り回されるだけになってしまいます。シリーズ「コロナのデータを理解する」では、そんなデータの見方や専門用語を解説します。第1回は「基本再生産数」と「実効再生産数」の基本について、正しく理解しましょう。 基本再生産数ってなに？ 病原体自体の感染力の強さと考えましょう。“まだ誰もその免疫を持っていない集団の中で、1人の感染者が次に平均で何人にうつすか”を表した指標です。基本再生産数は「R0」の記号で表されます。インフルエンザの基本再生産数はおおよそ1～3、麻疹ではおおよそ12～18と報告されています。 “すでに感染が広がっている状況において、1人の感染者が次に平均で何人にうつすか”を示す指標です
米山 隆一 on Twitter: "大阪の実効再生産数Rt=1.85なので、「人と人との接触5割削減」をしなければRt=0.925として感染を減少できません。漠然と感染症対策を訴えるのではなく、どうやって個別の削減を積み上げて「5割削減」に到達するかを考え、提示し、… https://t.co/VbSfybYGbp"
大阪の実効再生産数Rt=1.85なので、「人と人との接触5割削減」をしなければRt=0.925として感染を減少できません。漠然と感染症対策を訴えるのではなく、どうやって個別の削減を積み上げて「5割削減」に到達するかを考え、提示し、… https://t.co/VbSfybYGbp
東洋経済サイトの実効再生産数は偽物だよ
あそこで出している数字は、直近１週間の陽性人数と、その前の１週間の要請人数の比を、５分の７乗しただけの物だから、本当は実効再生産数でも何でもないよ。 東洋経済の新型コロナ感染状況サイトにはこう書いてある。 実効再生産数とは「1人の感染者が平均して何人に感染させるか」を表す指標。 計算式は「（直近7日間の新規陽性者数／その前7日間の新規陽性者数）^（平均世代時間／報告間隔）」。 平均世代時間は5日、報告間隔は7日と仮定。リアルタイム性を重視して流行動態を把握するため、報告日ベースによる簡易的な計算式を用いている。 精密な計算ではないこと、報告の遅れに影響を受けることに注意。 モデルと監修は北海道大学大学院医学研究院・西浦博教授。 計算式の詳細は西浦教授の公開するGitHubリポジトリを参照。 これを簡潔にすると、 (直近7日間の新規陽性者数 / その前7日間の新規陽性者数)(5/7) 新規要
新型コロナの全国の新規感染者は減少傾向にあるが、死者数や重症者数は最多の水準が続く。延長期限の３月７日に緊急事態宣言を解除するには、死者・重症者を減らす必要がある。政府の新型コロナウイルス感染症対策分科会は２日、気を緩めず、飲食店の時短営業継続など感染予防対策を継続する必要があると提言した。（井上靖史、藤川大樹、原田遼）
以下のツイートを目にして、実際の測定値はともかく、感染モデル上は感染が収まった時に実効再生産数はどうなるのか、という疑問を抱いた。 皆さん大事なことなので誤解の内容にお願いします。この数字は感染者数が下がりきると必ず1になります。 https://t.co/InyzZjb5ac— 理系の感染症医 (@rikeicorona) 2021年10月1日 SIRモデルについては、RIETIの関沢洋一氏がExcel上で仮想的な数字で計算できる方法を公開している。また、基本再生産数を含めたSIRモデルの簡単な解説としてはここで読める鈴木＝西浦論文がある*1。関沢氏は感染率をb、除去率をcという記号で表しているので、基本再生産数R0はb/cとなる。b=1.5、c=0.5という関沢氏の数字を使えば、R0=3である。また、実効再生産数Rtは、同様に関沢氏の表記を使えば、R0×S(t)/S(0)で計算できる。
東洋経済が新型コロナ｢実効再生産数｣を公開
先ほどのグラフを見ると、足下の実効再生産数は1未満でありながらも若干の上下が見られる。このあたりの解釈は、先ほどの報告遅れのバイアスに加え、新規感染者の絶対数などとも併せて考える必要があるだろう。 例えば、実効再生産数1が続いたとしても、日々の新規感染者が500人のときと、数人のときでは状況は大きく異なってくる。また新規感染者が1人から2人に増えた場合は、実効再生産数は2に跳ね上がる。こうした事象はすでに都道府県別の実効再生産数で起きており、新規感染者数が非常に少ない状況の中では、実効再生産数の数値だけでなく、総合的に判断する必要がある。 実際の計算式はどうなっているか 最後に、専門性の高い読者のために、実際の計算式にも触れておこう。東洋経済オンラインが掲載している実効再生産数の計算式は、次のとおりだ。
菅首相、ドイツの研究所が試算した経済ダメージを抑える実効再生産数「０・７５」に疑問「日本は全然違ってますから」 - スポーツ報知
菅首相、ドイツの研究所が試算した経済ダメージを抑える実効再生産数「０・７５」に疑問「日本は全然違ってますから」 菅義偉首相が１６日放送の日本テレビ系「ｎｅｗｓ ｚｅｒｏ」（月～木曜・午後１１時。金曜・午後１１時半）に収録出演した。 菅首相をインタビューした有働由美子キャスターは、１人の感染者が何人に広がるかを示す「実効再生産数」が「０・７５」になるよう感染対策すると経済へのダメージが少ないとドイツの研究所が試算していることに関連して「もちろん日本とは状況が違いますが、こういう分かりやすい明確な数字、指標を出して国民に頑張ろうよと呼びかけるのはわかりやすいと思うんですが、こういうものを出すおつもりはないですか？」と質問した。 これに菅首相は、ドイツの研究所が試算した「０・７５」について「だけど私、これどうかと思うんです」と疑問を投げかけた。 その理由を「ドイツは日本の人口の４分の３、８０００
手を洗う救急医Taka on Twitter: "実効再生産数1.1で2/4を迎えているわけですが、2/9までにピークアウトらしいです。 ほぼ確実に外すと思いますので、しっかり検証しましょう。 https://t.co/cU9NdmrqDV"
実効再生産数1.1で2/4を迎えているわけですが、2/9までにピークアウトらしいです。 ほぼ確実に外すと思いますので、しっかり検証しましょう。 https://t.co/cU9NdmrqDV
Yuki FURUSE 古瀬祐気 on Twitter: "イギリスのビッグデータ解析。実効再生産数と人流が有意に相関した場所は、職場・駅（都市部のみ）・娯楽（飲食店/ショッピングセンター/テーマパークなど）・スーパーや日用品店。 有意な正の相関がなかったのは、駅（都市部以外）・公園・住… https://t.co/Q4gOwcrB4t"
イギリスのビッグデータ解析。実効再生産数と人流が有意に相関した場所は、職場・駅（都市部のみ）・娯楽（飲食店/ショッピングセンター/テーマパークなど）・スーパーや日用品店。 有意な正の相関がなかったのは、駅（都市部以外）・公園・住… https://t.co/Q4gOwcrB4t
東京大学医科学研究所が主宰する研究コンソーシアム「The Genotype to Phenotype Japan（G2P-Japan）」は、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の懸念される変異株（VOC：variant of concern）の1つである「オミクロンBA.5株」のウイルス学的特徴を、流行動態、免疫抵抗性、および実験動物への病原性等の観点から明らかにした。 同コンソーシアムは、統計モデリング解析により、オミクロンBA.5株は、オミクロンBA.2株と比較してヒト集団内における実効再生産数が1.4倍高いことを発見。また、BA.5株は、BA.2株や他の亜系統株と比べて感染や3回のワクチン接種によって誘導される中和抗体により抵抗性を示すこと、BA.2株とBA.5株では抗原性（抗原となる物質が抗体を特異的に認識して結合する性質）が異なることを明らかにした。 さらに、オミクロンBA
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「オミクロンの実効再生産数はデルタの3〜4倍」 8割おじさんが警鐘を鳴らす変異株の“ズル賢さ”
新型コロナ「勝負の3週間」の感染状況 「実効再生産数」で分析 | NHKニュース
東京の感染拡大、「もうすぐピークアウト」は本当？実効再生産数をもとに「断定するのは時期尚早」と専門家は指摘
“宣言”2週間「実効再生産数」11都府県の多くで前週より低く | NHKニュース
「実効再生産数」 11都府県で「1」超続く 緊急事態宣言1週間 | NHKニュース
札幌の実効再生産数と旅客数が一致！ 西浦教授も相関を認める GoToトラベルは感染拡大に寄与か？
コロナ第3波襲来か クラスター相次ぎ実効再生産数も悪化｜日刊ゲンダイDIGITAL
英変異株、実効再生産数最大0.7引き上げ 感染力の強さ裏付け 研究チーム調査 | 毎日新聞
実効再生産数に波が生じる理由 - himaginary’s diary
感染者数の変曲点と実効再生産数の系統性を使ったピークアウトの予測｜水野義之
Hiroshi Nishiura on X: "京大と感染研の共同。反事実仮想を実効再生産数の成分で作成し、2021年予防接種2回が仮に無かった時の流行を作り因果推論を実施。2021年2月～11月末で6330万(6320-6360万）が感染し36.4万人が死亡する計算になり、実際には470万人感染・1万人死亡。差分は予防接種で逃れた。 https://t.co/YqR0CshH0G"
解除のカギを握るのは実効再生産数0.8の維持＜緊急事態宣言延長＞：東京新聞デジタル
SIRモデルでの実効再生産数の極限は？ - himaginary’s diary
BA.5株は実効再生産数が1.4倍、ワクチンに抵抗性＝東大など