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生物とRに関するxiangzeのブックマーク (3)

  • irisの正体 (R Advent Calendar 2012 6日目) - どんな鳥も

    R Advent Calendar 2012の6日目です. Rのデータセットでもっとも有名なのが,irisではないでしょうか.FisherもしくはAndersonのアヤメの計測データですね.しかし,有名なわりには,このデータセットの正体はそれほどよく知られていないように思います (私もよく知らずに使っていました). そこで,このエントリでは,どんな研究でirisデータセットが報告されたのか,元の論文2報について,その概要を述べてみたいと思います ※1. アヤメIris属 (アヤメ属) はアヤメ科に含まれる属のうちのひとつで,世界の温帯に150種が知られているようです (アヤメ属 - Wikipedia).irisデータセットに含まれるIris setosa,Iris versicolor,Iris virginicaは,このアヤメ属に含まれる植物のうちの3種です. どんな論文で報告されたの

    irisの正体 (R Advent Calendar 2012 6日目) - どんな鳥も
  • 専門外の人でも『遺伝統計学の基礎』を読むべき理由|Colorless Green Ideas

    遺伝研究者だけでなく、統計を使う必要がある人ならば読むに値する。やさしくはないが、様々な統計手法が分かりやすく書かれている。また、概念でなく、目的や意義をベースに説明しているという特徴がある。 はじめに 今日は、以下の遺伝統計学に関するを紹介したい。タイトルに「遺伝統計学」と書かれているが、遺伝と関係のない分野の人にとっても、統計を学ぶ際に有用なであると思う。 山田亮 (2010). 『遺伝統計学の基礎―Rによる遺伝因子解析・遺伝子機能解析』 東京:オーム社. このは、タイトルにあるように、遺伝に関わる現象を数理的・統計的に扱う手法について書かれている。このため、出てくる事例は遺伝に関するものが多いが、こので扱われている数理的・統計的手法は他の分野に通用する。 また、説明も非常に分かりやすく、かなり読みやすい教科書である。遺伝の研究者であるかどうかに関わらず、統計を使う必要がある分

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