pythonでNUTSの実装 - やったことの説明
はじめに 前回 ハミルトニアンモンテカルロ法の実装をやった． 今回は No U-Turn Sampler (NUTS)の実装をやる． 論文を参考にした． コードはここにもある github.com NUTS ハミルトニアンモンテカルロ (HMC)はパラメータの勾配を利用して， 効率的にMCMCサンプリングを行うことができる手法だった． HMCの問題点は2つ． 更新ステップ数 を適切に指定しなければいけない． 更新の大きさ を適切に指定しなければいけない． NUTSは更新ステップ数を自動的に決定する手法である． 論文内でははdual-averaging (Nesterov 2009)を用いて決定するが，今回は決め打ちにする． 更新ステップ数L ハミルトニアンモンテカルロでは,正規分布によって発生させた運動量を与えて， ステップの間，点を動かす． 予め決められたステップの間，点を動かすので，例
Discontinuous Hamiltonian Monte Carlo for discrete parameters and discontinuous likelihoods
Hamiltonian Monte Carlo has emerged as a standard tool for posterior computation. In this article, we present an extension that can efficiently explore target distributions with discontinuous densities. Our extension in particular enables efficient sampling from ordinal parameters though embedding of probability mass functions into continuous spaces. We motivate our approach through a theory of di
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