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生命科学に関するotori334のブックマーク (543)

  • 渋み - Wikipedia

    京都の河井寛次郎記念館 渋み(しぶみ)は味を分類する概念の一つ。また、日の伝統的な美意識の一つでもある。 概要[編集] 渋みは、柿の渋のような味を表す。華やかでなく落ち着いた趣がある。地味で深い味わいを指す。したがって、品を味わう味を分類する概念とされる。また、美術・工芸を表現する概念でもある。「渋い」と形容し、接尾語「さ」により「渋さ」と体言化する。 渋み物質と感覚[編集] 渋柿 渋味物質は、主にアルミニウム、亜鉛、クロームのような多価の金属イオン、植物タンニン、エチルアルコール、アセトンのような脱水性溶媒、ハロゲン化酢酸を含む酸類の4種に大別される味というが、五基味ではなく触覚に近い感覚という[1]。 渋みと苦みは異なるものであり、例えば、柿渋の渋みはタンニン、茶葉の渋みはカテキン、苦みはカフェインによるものである[2][3]。 渋味は、味を分類する概念のひとつと考えられている。

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  • ソラマメ - Wikipedia

    ソラマメ(空豆[4]、蚕豆[4]、学名: Vicia faba)は、マメ科の一年草または越年草。別名、ノラマメ(野良豆)、ナツマメ(夏豆)[1]、テンマメ(天豆)、シガツマメ(四月豆)[1]、コヤマメ(高野豆)、トウマメ[1]。 名称[編集] 和名のソラマメの由来は、豆果(さや)が空に向かってつくため「空豆」[5][4]、またはサヤの中の見た目がカイコの繭に似ていることから「蚕豆」という字があてられた[5][4]など諸説ある。酒処では「天豆」と表示している場合も多い。 歴史[編集] 北アフリカ[5]、地中海、カスピ海沿岸[4]、北部アラビア地方[6]の西南アジアが原産地と推測される[7]。また、大粒種はアルジェリア周辺、小粒種はカスピ海南岸が原産地であるとする二源説もある。イスラエルの新石器時代の遺跡からも出土している。インゲンマメが普及する以前は、ソラマメは古代エジプトやギリシア、ローマ

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  • αシート - Wikipedia

    αシート構造中の水素結合のパターン。酸素原子は赤で、窒素原子は青で、水素結合は点線で示してある。Rはアミノ酸の側鎖である。 αシート構造中のペプチド鎖のスティック表示。 αシートとは、1951年にライナス・ポーリングとロバート・コリーによって考案された、仮想上のタンパク質の二次構造である[1][2][3]。αシートの水素結合のパターンはβシートと類似するが、ペプチド結合のカルボニル基とアミノ基の配向が異なっており、カルボニル基はシートと順方向、アミノ基はシートと逆方向を向いている。そのためαシートは元々電荷を持っていて、カルボニル基の向いている方がマイナス、アミノ基の向いている方がプラスに帯電している。またαヘリックスやβシートなどと異なり、立体配置的にどのアミノ酸でも取れるわけではない。また天然のタンパク質構造中には滅多に見られないが[4]、分子動力学法のシミュレーションによると、アミロ

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  • 細菌のマジック:2方向照明暗視野顕微鏡法の開発

    茨城大・足立教授の協力により、運動性の高いスピロヘータ(Brachyspira pilosicoli)をこの研究に使わせていただきました。 スピロヘータの遊泳速度とらせん回転数を同時に測定するために、「2方向照明暗視野顕微鏡法」を開発しました。これにより、v-f ratioを効率よく解析できるようになりました。 2方向照明暗視野顕微鏡法の原理図(1)。 らせん形の物体に一方向から照明すると、照明光に直角な向きの部分が明るく、平行な部分が暗くなる(レーザー暗視野顕微鏡法の原理)。直交する2方向から別の色の光で照明すれば、左図のように、スピロヘータ細胞全体が可視化され、さらに各部分の色がらせん波の位相に対応する画像を得ることができる。 2方向照明暗視野顕微鏡法の原理図(2)。 細胞全体が可視化されているので、その中心位置を機械的に求めることができる。中心位置の特定の色(例えば、緑色)の輝度の時

  • イオノフォア - Wikipedia

    英語版記事を日語へ機械翻訳したバージョン(Google翻訳)。 万が一翻訳の手がかりとして機械翻訳を用いた場合、翻訳者は必ず翻訳元原文を参照して機械翻訳の誤りを訂正し、正確な翻訳にしなければなりません。これが成されていない場合、記事は削除の方針G-3に基づき、削除される可能性があります。 信頼性が低いまたは低品質な文章を翻訳しないでください。もし可能ならば、文章を他言語版記事に示された文献で正しいかどうかを確認してください。 履歴継承を行うため、要約欄に翻訳元となった記事のページ名・版について記述する必要があります。記述方法については、Wikipedia:翻訳のガイドライン#要約欄への記入を参照ください。 翻訳後、{{翻訳告知|en|Ionophore|…}}をノートに追加することもできます。 Wikipedia:翻訳のガイドラインに、より詳細な翻訳の手順・指針についての説明があります。

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  • Apis cerana japonica - Wikipedia

  • うなぎが絶滅する瞬間を見たいという欲望

    あんまり表立って言えないのだけれど、うなぎが絶滅する瞬間を見たい。 昔から環境保護に関心があって、特に人間によって絶滅した種に異常な関心があった(ここでは「果たして『人間によって絶滅した』と言われている種の絶滅要因は当に人間であったのか」という議論は無視する)。 自分では性根がやさしく、動物に対するシンパシーが高いためと思っていたのだが、どうやら違うようだと最近気づいた。 私はおなかが空いていたのだ。 リョコウバトの肉をべたハンターたちに嫉妬していたのだ。 ドードーの肉をべた船乗りたちを羨んでいたのだ。 この世で万金を積んでも味わうことのできない料理があるとするならば、それはメガネウの丸焼きであり、マンモスのステーキであるはずだ。そういう動物たちはまさに「美味い」という理由によって絶滅へと追い込まれたのである。 特にドードーがべたい。どの文献を見ても、「ドードーはまずい」と書かれた

    うなぎが絶滅する瞬間を見たいという欲望
  • マイクロ流体力学 - Wikipedia

    この項目「マイクロ流体力学」は翻訳されたばかりのものです。不自然あるいは曖昧な表現などが含まれる可能性があり、このままでは読みづらいかもしれません。(原文:en:Microfluidics) 修正、加筆に協力し、現在の表現をより自然な表現にして下さる方を求めています。ノートページや履歴も参照してください。(2016年9月) マイクロ流体力学 (Microfluidics) は、工学、物理学、化学、生化学、ナノテクノロジー、生物工学にまたがる学際的な分野であり、小体積の流体の多重化、自動化、高スループットスクリーニングなどの実用的応用がある[1]。マイクロ流体力学は1980年代初頭に出現し、インクジェットプリントヘッド、DNA チップ、ラボオンチップ技術、マイクロ推進技術、マイクロ熱工学技術の開発に応用されている。この分野では小さな、典型的にはミリメートル以下のスケールに幾何的に拘束された流

  • 『円偏光を反射するコガネムシ(続き)』

    前回、コガネムシが左回り円偏光の光を反射していることを書きました。今回は、その仕組みについて簡単に説明してみましょう。 まず、昆虫の表皮についての復習です。昆虫の表皮はクチクラと呼ばれる堅いタンパク質でできています。クチクラはいくつかの層になっていて、外側から、外表皮、外原表皮、内原表皮と名付けられています。詳しく言うと、外表皮の外側にはセメント層やワックス層があって、体内の水分が外に逃げないようになっています。これらのクチクラの層は表皮細胞で分泌されます。外表皮は最初に分泌され、その次に外原表皮、さらに、内原表皮の順に分泌されていきます。内原表皮は、若い時には毎日分泌されます。それで、ある程度、表皮が厚くなると、脱皮という手段で表皮を脱ぎ去ります。 さて、分泌されるクチクラはたんぱく質ですが、普通、これにキチンという多糖高分子が加って繊維状になっています。その繊維の並び方に特徴があります

    『円偏光を反射するコガネムシ(続き)』
  • Ho:YAGレーザーとは

  • シミ目 - Wikipedia

    シミ目(シミもく、総尾目、房尾目、Zygentoma)は、昆虫綱の1目。「シミ(衣魚、紙魚)」と総称される。当初は人家に生息して害すると思われていたため、「紙魚」と書かれる。英語では「silverfish」という。 かつては、無翅類の1目で現在のイシノミ目、および昆虫でないが近縁とされるコムシ目を含むこともあったが、これらは現在ではシミ目より基盤的な系統として分けられている[1][2]。 シミ目は原始的な特徴を持った昆虫の1つである。地球に存在する100万種ともいわれる全生物種の約6割を占める昆虫類のうち、シミ目はごくわずかであるが、これは進化の過程で無翅類が短期間で翅を獲得したためと考えられている[3]。 シミ目は昆虫としては原始的な無変態であり、卵から孵化した幼虫は成虫とほぼ同じ形で、蛹などの段階を経ないまま脱皮を繰り返し、成虫となる。脱皮によって変化するのは大きさだけで、形態の

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  • 分子シャペロン|一般社団法人 日本生物物理学会

    (2009/05/16) タンパク質のフォールディング 生命活動の万能の担い手であるタンパク質はアミノ酸が連なった「ひも」状のポリマーです。「ひも」というとぶらぶらの状態を想像するかもしれませんが、タンパク質はそのようなぶらぶらの状態では基的にははたらくことはできません。アミノ酸の並び方(配列)に特有のある「かたち」(立体構造)に折れたたむ必要があるのです。その折れたたみはフォールディングと呼ばれていて、生命科学の重要な課題として長年研究が進められていますが、まだ十分に理解されているわけではありません。例えば、ヒトゲノムをはじめとする多くの生物のゲノム情報が解読されている現在、何万というタンパク質のアミノ酸配列情報はありますが、それらが最終的にどのような立体構造になるのかを知ることは今でも困難です。 ただ、フォールディングというのは基的には簡単でアミノ酸配列さえ決まれば自動的にフォール

  • ORD・CDの基礎(1) ORD、CD測定の原理 | 日本分光株式会社

    ORD・CDの基礎(1) ORD(Optical Rotatory Dispersion)、CD(Circular Dichroism)測定の原理 光が電磁波であることは、紫外可視分光光度計の基礎(1) 光の性質で述べた通りです。電磁波は、直行する電場と磁場中を進行方向に垂直に振動して伝わる横波です。自然界の光には、様々な向きに振動する光の成分が含まれています。これに対し、振動面がそろった光が直線偏光(図1上)、光の波の進行に伴い振動面が回転する偏光が円偏光です(図1下)。

    ORD・CDの基礎(1) ORD、CD測定の原理 | 日本分光株式会社
  • 蛋白質科学会アーカイブ 表面残基エントロピー減少法による結晶化を目指した蛋白質への変異 導入 ―βシートモデル蛋白質の結晶化を例として

    otori334
    otori334 2022/07/09
    表面残基エントロピー減少法による結晶化を目指した蛋白質への変異導入 βシートモデル蛋白質の結晶化を例として
  • 表面残基エントロピー減少法による結晶化を目指した蛋白質への変異導入 ―βシートモデル蛋白質の結晶化を例として | 蛋白質科学会アーカイブ

    概要 蛋白質のX線結晶構造解析において、蛋白質結晶の作製は必須のステップである。通常、百から千程度の結晶化条件をスクリーニングし、目的蛋白質が結晶化する条件を探索する。しかしながら、多くの蛋白質が結晶化スクリーニングを行った後でも結晶化せず、結晶構造決定のボトルネックとなっている。これまでに、結晶化しない蛋白質を結晶化させるための試みが数多く提案されてきた。例としては、相同な蛋白質のDNAシャッフリング(1)や対称的に多量体化させcrystal contact数を減少させる方法(2)などがある。それぞれの方法論には一長一短があり、どの方法が最良であるとは言えないが、プロトコルでは比較的に広く用いられている、表面残基エントロピー減少法(Surface Entropy Reduction Method)について筆者の行った例と合わせて解説する。 イントロダクション 表面残基エントロピー減少法

  • 羽毛 - Wikipedia

    「羽根」はこの項目へ転送されています。「鳥の羽」については「翼」を、「昆虫の翅(し)」については「昆虫の翅」をご覧ください。 羽毛(うもう、英: Feather)とは、鳥類および(一部の)恐竜、翼竜[1]の体表を覆う表皮の変形物である。皮膚から出るケラチン質のもので、爬虫類の鱗、哺乳類の毛に相当する。飛翔において重要な役割を果たし、浮力や保温の為に空気を蓄える役割も大きい。 構造[編集] 羽毛(正羽)の構造 羽区 羽毛には「正羽(せいう)」と「綿羽(めんう)」がある[2]。 正羽は板状の羽毛で、中心の羽軸とその両側の羽弁からなり、羽弁は多数の羽枝と羽小枝が互いに鉤で組合わさっている。体表面上の「羽区」とよばれる特定の領域に生える。 綿羽は板状にならない羽毛で、重なり合った正羽の下に生え、羽軸がないか、あっても非常に柔らかく、羽小枝が鉤で結び合っていない。ふわふわした手ざわりで、主に保温と防

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  • 蠕動 - Wikipedia

    模式化した消化管の蠕動 蠕動(ぜんどう、英語: peristalsis)は、筋肉が伝播性の収縮波を生み出す運動である。 蠕虫などの体壁筋や、動物体内の消化管などの中空器官で行われる。前者では動物体の移動のため、後者では内容物の移送のために行われる。 縦走筋 (longitudinal muscle) と環状筋 (circular muscle) が拮抗する平滑筋系によって行われる。両者を相互的に支配する縦走性神経系による、独立・自立的な活動である。

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  • RESEARCH 生きた膜を支える脂質の分子運動

    1.細胞膜を動く脂質分子 1972年にシンガーとニコルソンが発表した生体膜の流動モザイクモデル(註1)は、それまでの細胞膜の静的なイメージを一新した。そのモデルは、細胞の内と外を隔てているだけと思われてきた膜が、実は脂質分子が集合した非常にやわらかい二分子膜構造であり、膜を構成する脂質分子は活発に動き回っているというものであった。そこで、脂質二分子膜内に浮かぶように存在しているタンパク質などの機能分子が、流動的な膜の中でどのようにはたらき、制御されているかを解明することが膜の理解につながるとして活発に進められてきた。 ところが、膜を構成する主要物質である脂質分子については、生体膜内を流動はするものの、特に生理機能は持たないという見方が続いていた。確かに脂質は、酵素などと異なり、分子一つで特定のはたらきを担うことはほとんどない。しかしこれだけの流動性が機能につながらないはずはないと考え、脂質

    RESEARCH 生きた膜を支える脂質の分子運動
  • 接ぎ木 - Wikipedia

    V字に接ぎ木し固定されたリンゴの木 接ぎ木(つぎき)とは、2個以上の植物体を、人為的に作った切断面で接着して、1つの個体とすることである。このとき、上部にする植物体を穂木(接穂、継穂、ほぎ、つぎほ)、下部にする植物体を台木という。 通常、遺伝的に異なる部分から構成されている個体を作る技術として用いられるが、穂木の増産・入れ替え、根の病害虫対策、狭い果樹園での受粉、果樹等の育種年限の短縮化、げっ歯類などから受けた傷の治療、接木キメラの育成などの目的で行われる場合もある。 柑橘類の台木にデコポンを接ぎ木した例(左は接ぎ木後に新たな葉が成長、右上は接ぎ木に失敗し枝が枯れる) 接ぎ木は、挿し木や取り木と同じく有用植物を枝単位で栄養生殖させる方法である。他の方法と根的に異なるのは、目的とする植物の枝から根を出させるのではなく、別の植物の根の上に目的の植物の枝をつなぐことである。接ぎ穂と台木は近縁な

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  • 正常型プリオンタンパク質の分子内相互作用解析