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ブックマーク / qiita.com/moshi (1)

  • PythonでChord Diagramをプロットする方法 - Qiita

    Chord Diagramプロット方法 pyCirclizeを利用したChord Diagramのプロットコード例・図例を以降に記載しています。 1. 行列テーブルからプロット プロット方法は簡単で、Circos.initialize_from_matrix()メソッドから行列データ読み込み及びChord Diagramプロット設定を行い、savefig()メソッドで図を出力するだけです。プロット設定は各要素間のスペース度数やカラーマップ、ラベル位置・サイズ、リンクの方向等の設定が可能です。 1-1. Example1 (3 x 6 行列) from pycirclize import Circos import pandas as pd # Create matrix dataframe (3 x 6) row_names = ["S1", "S2", "S3"] col_names =

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