Qiime2でITS領域を解析して真菌について調べる - Qiita

本稿の狙い Qiime2で16Sだけでなく、ITS領域の解析もできるようにする。 ITS領域を調べる意味 ITS領域はInternal transcribed spacersの略で真核生物のリボソームDNA（rDNA）において、18S、5.8S、28Sの各リボソームRNA（rRNA）をコードする遺伝子の間に存在する領域のことである。16S rRNAシーケンスがバクテリアの微生物叢を調べるのに用いられるのに対して、ITS領域は真菌の微生物叢を調べるのに用いられる領域である。つまり、例えば日本酒の微生物叢を調べようとすると、16Sではあまり使い物にならない可能性が高そうだと考えられる。真菌を調べるために18Sを用いる場合もあるが、ITSは土壌向けなどと言う意見もある。また、ITSの方が正確だとする論文もあったような気がする。 参考: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/p