Gaussian Tips | HPCシステムズ・計算化学ソリューション
HPCシステムズは、Gaussian入門者の皆様に、Gaussianを使いこなして高度な計算化学者に飛躍していただけるよう、Gaussianに関する様々な情報を発信しております。 （0-1） ごあいさつ 平素より弊社のGaussian入門メールニュースをご購読いただき、ありがとうございます。今回から新シリーズ「Gaussian計算エラー対処・虎の巻」の連載を配信いたします。 Gaussian（に限らず、どの計算ソフトでもそうですが）初心者にとって一番の悩みの種は「計算がエラーで止まってしまった！でもどうすればいいかわからない。」とか「結果が何かおかしい。どこがいけなかったのだろうか？」といった疑問ではないでしょうか。本メールニュースではそのような疑問の解決に少しでもお力添えするべく、よくあるエラーを中心に、直接的な対処法から簡単な理論的背景まで含めて解説していく予定です。 もちろん、一口に
動径分布関数（RDF）とは？ | HPCシステムズ・計算化学ソリューション
分子動力学シミュレーションから得られる情報の一つが、動径分布関数（RDF, Radial Distribution Function）です。この値から溶質分子の溶媒効果や錯体金属の配位数など、さまざまな情報を得ることができます。 動径分布関数は、原子（あるいは分子）の分布を示したもので、ある原子に着目してその周囲に位置する原子の分布（存在確率）を距離 r の関数として定義されます。なお、動径分布関数 ρ(r) の単位は、原子数、分子数、密度、無限遠で1になるように規格化、など目的により異なっています。
ご使用方法 | HPCシステムズはすべての研究開発者に計算力を提供します。
各種研究機関や教育機関ではMacintoshマシンをご利用している研究者の方々が多数おいでになります。 その洗練された外観やインタフェース、UNIXとの親和性、管理のしやすさなどから根強い人気があるものと思われます。 入力ファイルの準備や計算結果のビジュアライズを行うワークステーションとして利用するために、ご自身のMacintosh マシンをLinuxクラスタ計算機に接続してログインする方法について以下にご説明いたします。 『ターミナル』を使ったキャラクタベース(CUI)での接続 Mac OS Xには標準の端末エミュレータとして『ターミナル(Terminal)』アプリケーションが付属しています。 1. インストール OSに標準で装備されているため、別途インストールを明示的に行う必要はありません。 2. 起動方法 『Finder』から、[アプリケーション]-[ユーティリティ]-[ターミナル]
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