GSEA softwareの使い方 基本編 統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネルを作り終えた。このソフトウェアは、どの遺伝子がどの程度発現しているかを調べた実験結果を二種類以上与えると、その結果を比較し解釈の手助けをしてくれるソフトウェアだ。全く適当にな例だが、 発現データ 肥満の個体 正常な個体 遺伝子A 100 11 遺伝子B 100 50 遺伝子C 30 30 遺伝子D 20 90 遺伝子E 40 70 と、事前の研究や計算の結果より分かっている同一機能に関係する遺伝子のセットのリスト 遺伝子セット1 : インスリン分泌に関わる遺伝子:A,B,D,H,I 遺伝子セット2 : 酸化的リン酸化に関わる遺伝子:D,E,F,G,Z 遺伝子セット3 : 細胞接着に関わる遺伝子:C,F,X,Y . . .をGSEA softwareに投げると、GSEA softw