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2017.12.23 R は計算をメインに行う統計解析用だが、文字列の切り出しや置換などの文字列処理を行う関数も用意されている。文字列の分割や正規表現を用いたパターンマッチングなども行える。 文字列マッチング関数 文字列のパターンマッチは grep と regexpr を利用する。一方、完全一致による文字列マッチングを行う場合は match または charmatch を利用する。 パターンマッチ grep regexpr grep はマッチしたかどうかを返すのに対して、regexpr はマッチした位置やマッチした長さなどを返す。grep と regexpr のパターンには正規表現を用いることができる。 files <- c("NM20001.gb", "NN30012.gb", "NM20111.fa", "NM20121.fa") #「.gb」で終わる要素を検索 grep("\\.gb
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農学生命情報科学特論 I ＠東京大学アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット (2023-10) プログラミング言語未経験者を対象とした Python 入門講義。農学や分子生物学などの分野で利用される Python の最新事例を紹介しながら、Python の基礎文法の講義を行う。
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物体検出入門 (2021-11) online MMDetection および Detectron2 を利用して物体検知を行う方法を中心に取り扱う。 BioC Asia 2021 Workshop (2021-11) online 主要介绍使用 R 语言中的 torch 包来搭建卷积神经网络做物体分类以及搭建循环神经网络做回归预测的方法。学习神经网络的基础知识请参照 PDF 资料。学习实际操作请参照 GitHub 网页。
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