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２０２１年度　バイオインフォマティクス　講義ノート 『バイオインフォマティクス』 （２０２１年度春学期） 第１回講義ノート　（４月１２日分） 第２回講義ノート　（４月１９日分） 第３回講義ノート　（４月２６日分） 第４回講義ノート　（５月　３日分） 第５回講義ノート　（５月１０日分） 第６回講義ノート　（５月１７日分） （５月１７日は，授業時間中にオンラインリアルタイムで演習を行います．） 第７回講義ノート　（５月２４日分） 第８回講義ノート　（５月３１日分） 第９回講義ノート　（６月　７日分） （６月７日は，授業時間中にオンラインリアルタイムで演習を行います．） 緊急事態宣言の発出により，５月１０日（月）に対面で行う予定だった演習は，翌週の５月１７日（月）に延期します． それに伴って，５月１０日は，通常の講義をオンライン（動画配信）で行います． 緊急事態宣言が延長になったため，５月１７日

河田 雄次 慶応義塾大学院 理工学研究科基礎理工学専攻 生命システム情報専修 後期博士課程 2 年 (10 月入学) 榊原研究室 → 医学部の仲嶋研究室でお世話になっています → 三菱総合研究所へ行かせて頂くことになりました (富田先生に仮親になっていただいています) 転写制御に関わる研究をしています。転写制御とは、ゲノム上の情報が最終的にタンパク質として発現する過程における、最初でかつ最大の影響を及ぼす制御機構であり、転写因子がゲノム上の特定の部分文字列 (モチーフ) に結合することで遺伝子発現の制御が行われます。但し、自然界における突然変異等の影響により、モチーフにノイズがのっている、すなわち単純な exact match では同定できないことが問題を難しくしています。 転写制御における配列解析問題は、与えられたモチーフを用いて結合部位を探索することと、

#---- プロンプト設定 ------# # 左プロンプト PROMPT='[%n@%m %~]${WINDOW:+"[$WINDOW]"}%# ' ## ## prompt_bang が有効な場合、!=現在の履歴イベント番号, !!='!' (リテラル) # ${WINDOW:+"[$WINDOW]"} = screen 実行時にスクリーン番号を表示 (prompt_subst が必要) # %B = underline # %/ or %d = ディレクトリ (0=全て, -1=前方からの数) # %~ = ディレクトリ # %h or %! = 現在の履歴イベント番号 # %L = 現在の $SHLVL の値 # %M = マシンのフルホスト名 # %m = ホスト名の最初の `.' までの部分 # %S (%s) = 突出モードの開始 (終了) # %U (%u) = 下線モー