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BioRuby は国産の高機能オブジェクト指向スクリプト言語 Ruby のための オープンソースなバイオインフォマティクス用ライブラリです。 Ruby 言語は Perl 言語ゆずりの強力なテキスト処理と、 シンプルで分かりやすい文法、クリアなオブジェクト指向機能により、 広く使われるようになりました。Ruby について詳しくは、ウェブサイト http://www.ruby-lang.org/ や市販の書籍等を参照してください。 BioRuby を使用するには Ruby と BioRuby をインストールする必要があります。 Ruby のインストール Ruby は Mac OS X や最近の UNIX には通常インストールされています。 Windows の場合も１クリックインストーラや ActiveScriptRuby などが 用意されています。まだインストールされていない場合は http:

BioRuby¶ ↑ Copyright © 2001-2019 Toshiaki Katayama <k@bioruby.org> BioRuby is an open source Ruby library for developing bioinformatics software. Object oriented scripting language Ruby has many features suitable for bioinformatics research, for example, clear syntax to express complex objects, regular expressions for text handling as powerful as Perl’s, a wide variety of libraries including web s

BioRuby/ChemRuby http://www.tmd.ac.jp/artsci/biol/textbook/celltop.htm 0 70 140 210 280 350 1995 96 97 98 99 2000 01 02 03 04 05 2000 / 1 / 27 • • • RefSeq PDB PubMed PubChem GenPept EMBL UniProt GenBank DNA( , ) DB GENES ENZYME PATHWAY COM POUND UCSC Ensembl KEGG DAS Bio::DAS (REST CGI) Bio::Flat(BDB) Bio::Fetch(HTTP) Bio::SQL(RDB) Bio::KEGG::API (SOAP/WSDL) Bio::GenBank, Bio::EMBL etc. E-Utils (

2023/09/27 BioRuby 2.0.5 released (ChangeLog) 2022/09/13 BioRuby 2.0.4 released (ChangeLog) 2021/11/06 BioRuby 2.0.3 released (ChangeLog) 2020/12/31 BioRuby 2.0.2 released (ChangeLog) 2019/09/06 BioRuby 2.0.1 released (ChangeLog) 2019/06/14 BioRuby 2.0.0 released (ChangeLog) 2018/09/20 BioRuby 1.5.2 released (ChangeLog) 2016/09/07 BioRuby 1.5.1 released (ChangeLog) 2015/07/10-11 BOSC 2015 (Abstrac