はてなブックマーク

• あとで読む

  TogoTV

  10 users

  togotv.dbcls.jp

  生命科学分野における有用な情報を紹介するウェブサイトです。 だれでも自由に閲覧し再利用することができます。 ・データベースやツールの動画マニュアル ・講演や講習会動画、資料 ・イラスト

  • 暮らし
  • 2018/11/12 23:36

  • 映像
• あとで読む

  生命科学系データベースアーカイブの使い方 2017

  4 users

  togotv.dbcls.jp

  生命科学系データベースアーカイブは、国内のライフサイエンス研究者が生み出したデータセットをわが国の公共財としてまとめて長期間安定に維持保管し、データ説明（メタデータ）を統一して検索を容易にすると共に、利用許諾条件などの明示を行うことで、多くの人が容易にデータへアクセスしダウンロードを行えるようにするバイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) のサービスの一つです。データベースそのものを丸ごとダウンロードすることができるほか、データベースにそれぞれDOIが付与されており、そのデータベースを引用する際に使用することができます。またこのアーカイブは、Scientific Data誌 の推奨レポジトリにもなっています(Scientific Data's recommended repositories)。

  • テクノロジー
  • 2017/10/11 17:33
• あとで読む

  Togo picture gallery

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  テキスト検索 絞り込み検索 フィルターをクリア タグ 生物分類 作者 形式 Togo picture gallery 選択 該当なし

  • 学び
  • 2017/08/10 13:15

  • 素材
• あとで読む

  Picture Gallery｜統合TV(togotv)|生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル

  5 users

  togotv.dbcls.jp

  生命科学分野のイラストをだれでも自由に閲覧・利用できるように無料で公開しています。 研究発表のスライド作成や資料作成等にお使いください。リクエストはこちら。 下のタグをクリックするとサムネイルをソートします。全作品のリストはこちら。 モデル生物 細胞 臓器 実験装置 次世代シーケンサー 顕微鏡 実験器具 模式図 活用事例 未分類 生物アイコン 海綿動物門 平板動物門 刺胞動物門 有櫛動物門 扁形動物門 環形動物門 軟体動物門 線形動物門 緩歩動物門 節足動物門 珍渦虫動物門 棘皮動物門 半索動物門 脊索動物門 藍色細菌門 緑藻植物門 被子植物門 プロテオバクテリア門 子嚢菌門 繊毛虫門 フィルミクテス門 襟鞭毛虫門 脊椎動物亜門 尾索動物亜門・頭索動物亜門 哺乳綱 鳥綱 両生綱 爬虫綱 昆虫綱 緑藻綱 頭足綱 貧膜口綱 襟鞭毛虫綱 バシラス綱 γプロテオバクテリア綱 獣亜綱 原獣亜綱 無顎

  • 学び
  • 2016/12/31 23:06

  • picture
• あとで読む

  無料統計ソフトEZR (Easy R)を使ってマウス操作だけで多彩な統計解析をする 〜導入・基本編〜

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  Rは、フリーで使える統計解析向けのプログラミング言語です。非常に多彩な解析を行うことができますが、コマンド操作が中心であるため、初心者には敷居が高い面もあります。 EZR (Easy R)は、Rでおこなえる多彩な解析やグラフ作成を、マウス操作だけでおこなえるツールです。本動画では､EZRの導入方法と基本的な操作について紹介します。

  • 学び
  • 2016/05/14 10:10

  • science
• あとで読む

  生物進化論の新しい展開 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  YouTube版を視聴できない方はオリジナル版ファイル(mov形式)をダウンロードして、ご覧ください。 本日の統合TVは、2016年1月30日(土)に三島市民文化会館小ホールで行われた太田朋子 国立遺伝学研究所名誉教授 クラフォード賞受賞記念講演会 から 太田 朋子 国立遺伝学研究所 名誉教授 による「生物進化論の新しい展開」をお送りします。 約62分です。 太田 名誉教授 は、2015年5月に、生物の進化の仕組みについて、画期的な研究成果を挙げた功績によりスウェーデン王立科学アカデミーからクラフォード賞を授与されました。これを受け、国立遺伝学研究所のある三島市の名声を高め、市民に夢と希望を与えたとして、三島市長特別賞が贈られました。その受賞記念として開催された講演会において、ご自身の研究「分子進化のほぼ中立説」に関することや女性研究者としてのこれまでの経験等をお話いただきました。 この動

  • 学び
  • 2016/02/08 08:19
• あとで読む

  inMeXesを使い倒す 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  YouTube版を視聴できない方はオリジナル版ファイル(mov形式)をダウンロードして、ご覧ください。 今回の統合TVでは、DBCLSが提供する、文献中の英語表現を軽快に検索するサービスinMeXesを紹介します。 PubMed/MEDLINEに含まれる書誌情報のタイトルやアブストラクトに10回以上出現する2語以上から成る英語表現を入力のたびごとに即座に候補を検索します。結果はPubMed/MEDLINE中での出現頻度と共に表示され、ある動詞の後に続く適切な前置詞を検索したり、ある単語の前後にどういう語がくることが多いかなどを検索することができます。

  • 暮らし
  • 2015/12/21 22:05
• あとで読む

  AJACS講習会資料

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  『統合TV』は、生命科学分野の有用なデータベースやツールの使い方を動画で紹介するウェブサイトです。 目的別に検索 関連するタグから検索 AJACS講習会資料 番組タイトル日時AJACS関連するタグ 微生物統合データベースMicrobeDB.jpの活用法2019-11-29AJACS世田谷講演 AJACS NGS メタゲノム 遺伝子 微生物 DBCLS で提供している文献情報サービスほか2019-11-29AJACS世田谷講演 AJACS 文献検索 文章執筆 辞書 NBDCの紹介とNBDCが提供するサービス2019-11-29AJACS世田谷講演 AJACS NBDC データベース 次世代シーケンサー（NGS）と関連するデータベースツール2019-11-29AJACS世田谷講演 AJACS NGS データベース ウェブツール 可視化 メタゲノム解析ツール2019-09-25AJACS十勝2実

  • テクノロジー
  • 2015/10/01 08:07

  • 研究
  • イベント
  • 開発
  • 資料
  • ビジネス
• あとで読む

  【NGS速習コース】1. コンピュータリテラシーとサーバー設計〜1-3. UNIX I(続)〜UNIXの基礎の理解、Linux導入

  29 users

  togotv.dbcls.jp

  【NGS速習コース】1. コンピュータリテラシーとサーバー設計〜1-3. UNIX I(続)〜UNIXの基礎の理解、Linux導入 本日の統合TVは、2014年9月1-12日に開催された、バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム（次世代シークエンサ）速習コース から、ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) 仲里 猛留 による「1. コンピュータリテラシーとサーバー設計 1-3. UNIX I(続) 〜UNIXの基礎の理解、Linux導入」をお送りします。約5時間13分です。

  • テクノロジー
  • 2014/12/06 23:54

  • linux
  • movie
  • あとで読む
• あとで読む

  RStudioでRを直感的に使おう

  6 users

  togotv.dbcls.jp

  Rはフリーでオープンソースの統計解析環境です。Rを使うとデータの操作や計算、可視化を統合して行うことができます。豊富に用意されたサンプルデータや、対話的な解析、網羅的なパッケージアーカイブCRANが特徴です。Windows, MacOSX, Linux とマルチプラットホームで利用可能です。今回はRの統合開発環境であるRStudioを紹介します。 見どころダイジェスト 1. RStudioのインストール(26秒) 01:52 2. プロジェクトの作成 03:11 3. RStudioの基本的な使い方 07:27 4. パッケージのロード・インストール 09:27 5. コードの作成・実行・保存

  • 学び
  • 2014/02/27 21:45

  • あとで読む
• あとで読む

  国立国会図書館サーチの使い方

  7 users

  togotv.dbcls.jp

  国立国会図書館サーチ (NDL Search)は、国立国会図書館が提供する総合検索サービスで、国立国会図書館をはじめ、全国の公共図書館、公文書館、美術館や学術研究機関等が持つ様々な形態の情報を検索することができます。 今回は、キーワード検索を中心に、検索結果の絞り込みや並び替え、資料の閲覧方法、博士論文の検索・閲覧の仕方など基本的な使い方について説明します。

  • 学び
  • 2013/11/21 19:42

  • 国立国会図書館
  • 図書館
  • 検索
  • video
• あとで読む

  UCSC Genome Browserの使い方～配列取得編～2013

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  UCSC Genome Browserは、 米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校(UCSC)が開発、維持しているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムです。ゲノムブラウザとはアノテーションが付加された遺伝子のゲノム上の位置やその周辺を表示するツールのことです。今回はUCSC Genome Browser 表示+ENCODE編に続いて興味のある遺伝子を検索し、その遺伝子の詳細情報とその配列の取得方法について詳しく説明しています。

  • 世の中
  • 2013/11/13 21:20
• あとで読む

  Cytoscapeを使いこなす ～インストール・基本操作編～

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  Cytoscapeとは、生物学上のパスウェイや分子間相互作用ネットワークを可視化＆解析できるフリーソフトです。もともとは生物学的ネットワークのためにオブジェクト指向型言語Javaで書かれたソフトですが、もちろん生物以外を対象にすることもできます。手軽な操作でネットワークの画像を出力することができ、また解析をすることもできます。外部のデータベースから情報を取得したり、ネットワークに関する情報を統合することもできます。今回は、その導入方法と基本的な使い方について説明します。Cytoscapeの使い方の資料としてこちらの講習会で使われたPDFもあります。 見どころダイジェスト 00:00 1. Cytoscape のダウンロードとインストール 01:20 2. ノードとエッジの追加・名前変更 03:35 3. ノードとエッジの設定変更 05:55 4. ネットワークのスタイル変更

  • テクノロジー
  • 2013/10/17 15:52

  • tutorial
  • data
  • network
• あとで読む

  文献管理ソフトMendeleyを使って論文を読む・前編

  4 users

  togotv.dbcls.jp

  Mendeleyは無料で使える文献管理ツール/SNSです。ファイルのドラッグ&ドロップでタイトル・著者・雑誌名等の情報を抽出してくれる複数のコンピュータやモバイル端末間で同期できる ・ユーザー同士の公開/非公開グループで情報の共有ができるオフィスソフトでの引用や参考文献リストが作成できる など様々な特長があります。 この動画と文献管理ソフトMendeleyを使って論文を読む・後編では、今まで読んできた/新しく読む論文のPDFデータをMendeleyで管理する方法や、Mendeleyの使い方のコツを紹介しています。 見どころダイジェスト 00:29 1. Mendeleyアカウントの作成とDesktopアプリのインストール 02:10 2. フォルダ監視を使ったライブラリへの文献追加 04:28 3. PDFファイルのリネームとサブフォルダへの階層分け

  • 学び
  • 2013/07/18 20:00

  • 研究
• あとで読む

  統合TV (togotv)

  9 users

  togotv.dbcls.jp

  統合TVは、ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が発信する生命科学分野の有用なデータベース(DB)やウェブツールの活用法を動画で紹介するウェブサイトです。くわしくは はじめての方へ をご覧ください。ご質問、ご要望は、お問い合わせ もしくは ライフサイエンスQA からお願いします。TogoTV beta ('togo' means 'integration' in Japanese) is an archive of tutorial videos expounding how to use biological databases and tools. Although most of contents are currently depicted in Japanese, you can find English contents in TogoTV internati

  • 学び
  • 2013/06/20 18:58

  • データベース
  • 動画
• あとで読む

  統合TV | 生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネル

  17 users

  togotv.dbcls.jp

  全番組のリストから、調べたいDBやウェブツールに関するキーワードで検索！ （全 件） 番組のタイトルや画像をクリックすると番組の再生ページへ移動します。番組リクエストやお問い合わせはこちらからどうぞ!

  • 学び
  • 2013/04/20 11:12

  • 図書館
  • 研究
  • search
  • 生物
  • video
  • TV
• あとで読む

  番組ランキング

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  番組ランキング 今よく見られている注目の番組や、これまで人気の番組を探したい！ 昨日の再生数ランキング 順位 変動 番組名 再生数 累計再生数

  • 暮らし
  • 2013/03/27 08:47

  • ranking
• あとで読む

  Open Refine（旧Google Refine）の使い方 〜導入・基本編〜

  21 users

  togotv.dbcls.jp

  Open Refineは、さまざまなデータをきれいに整形したり、欲しい形のものに変換したり、簡単な解析を行ったりすることができるソフトで、表計算ソフトExcelにはないさまざまな機能を持っています。元はGoogleのコンテンツで、Google Refineという名前で知られていましたが、2012年10月にオープンソース化され、Open Refineに改称されました。2012年2月現在、Google RefineからOpen Refineへの過渡期にあり、多くの情報はまだGoogle Refineのままとなっています。　この動画では、Open Refineの導入方法を説明した後、BioMartから取得したCSV形式のヒトの遺伝子の一覧のデータ（一部改変）を用いて、文字データの表記ゆれの統一や、数値データの大小の並び替え、指定した範囲に含まれるデータの抽出、列同士の演算の方法を紹介します。 見

  • テクノロジー
  • 2013/02/12 20:26

  • tutorial
  • database
  • misc
  • data
• あとで読む

  ImageJを利用して画像を処理・解析する

  5 users

  togotv.dbcls.jp

  ImageJは、NIH(National Institutes of Health)が開発した画像解析フリーウェアです。本ツールを利用して、TIFF・JPEGなど多くの形で保存された画像の編集・解析を行うことができます。今回は、ImageJのダウンロード、およびImageJを利用したゲル写真の半定量を行う方法を説明しています。

  • 世の中
  • 2012/11/19 10:20
• あとで読む

  いつも側にいるコラボレータ 〜Google+を使った共同研究の進め方〜

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  本日の統合TVは、2011年12月13〜16日にパシフィコ横浜にて開催された、第34回日本分子生物学会年会のフォーラム 『もし分子生物学者がGoogle+の招待を受けたら』から、二階堂 愛さん (@dritoshi)(理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター)による「いつも側にいるコラボレータ 〜Google+を使った共同研究の進め方〜」をお送りします。

  • テクノロジー
  • 2011/12/22 00:04

  • Google
• あとで読む

  生存戦略、しましょうか 〜或いは、最もスマートな研究職の探し方〜

  6 users

  togotv.dbcls.jp

  本日の統合TVは、2011年12月13〜16日にパシフィコ横浜にて開催された、第34回日本分子生物学会年会のフォーラム 『もし分子生物学者がGoogle+の招待を受けたら』から、大田 達郎さん （@iNut）（ライフサイエンス統合データベースセンター）による「生存戦略、しましょうか 〜或いは、最もスマートな研究職の探し方〜」をお送りします。

  • 世の中
  • 2011/12/21 14:03
• あとで読む

  統計解析ソフト「R」での立廻り

  8 users

  togotv.dbcls.jp

  Rはフリーでオープンソースの統計解析環境です。Rを使うとデータの操作や計算、可視化を統合して行うことができます。豊富に用意されたサンプルデータや、対話的な解析、網羅的なパッケージアーカイブCRANが特徴です。Windows, MacOSX, Linux とマルチプラットホームで利用可能です。生命科学分野のためのRパッケージプロジェクトである『BioConductor』では、500以上のパッケージが配布されており、マイクロアレイデータなどの遺伝子発現プロファイルや質量分析データ、タンパク質相互作用データなどを解析するうえで、欠かせないものとなりつつあります。今回はRを使う上で基本的な知識や、便利なウェブサイトを紹介します。また、実際にHuman Induced Pluripotent Stem Cell Epigenomesのデータを階層的クラスタリングを用いて解析します。この解析はHots

  • テクノロジー
  • 2011/11/07 18:46

  • R
  • 統計
  • science
  • programming
  • あとで読む
• あとで読む

  MEGAを使って配列アラインメントおよび系統解析をする

  6 users

  togotv.dbcls.jp

  MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)は、DNA、タンパク質配列データの分子進化・系統学的解析を行うためのフリーのソフトウェアで、Tamura K らによって作成されています。MEGAの特徴は、シークエンサーのファイル（ab1, abi, scfなど）を直接読み込めるため、波形データと配列データを一緒に解析できることです。また、Windows、Mac OS、Linuxとマルチプラットフォームで動作します。 今回は、いくつかの遺伝子（PPARやTP53など）を例として、多重アラインメントの実行と系統樹を作成する方法を説明します。

  • 学び
  • 2011/10/20 15:43
• あとで読む

  HeliScope CAGE法について@AJACS本郷9

  3 users

  togotv.dbcls.jp

  本日の統合TVは、2011年7月15日に開催された、統合データベース講演会: AJACS本郷9から、理化学研究所 オミックス基盤研究領域(OSC)伊藤 昌可 先生による「HeliScope CAGE法について」をお送りします。約33分です。

  • 世の中
  • 2011/09/08 16:34
• あとで読む

  Cytoscape を使い倒す!〜基本操作編〜

  6 users

  togotv.dbcls.jp

  Cytoscapeとは、生物学上のパスウェイや分子間相互作用ネットワークを可視化＆解析できるフリーソフトです。もともとは生物学的ネットワークのためにオブジェクト指向型言語Javaで書かれたソフトですが、もちろん生物以外を対象にすることもできます。手軽な操作でネットワークの画像を出力することができ、また解析をすることもできます。外部のデータベースから情報を取得したり、ネットワークに関する情報を統合することもできます。 今回は、その導入方法と基本的な使い方について説明します。

  • 暮らし
  • 2011/06/03 19:23
• あとで読む

  文献管理システム TogoDocの使い方

  6 users

  togotv.dbcls.jp

  TogoDocはDBCLSが開発・提供している文献管理システムです。 PubMed IDのリストを本システムに登録することで、 興味を持ちそうな関連文献を取得したり、各書誌情報に任意のタグを付けて整理することができます。またPubMed検索結果から適宜書誌情報を登録や、あるいはRIS形式のファイルをアップロードすることでも可能です。 さらに、普段お使いのPC (Win/Mac) にオンラインジャーナルからダウンロードした論文のPDFファイルを効率よく整理できるフリーの文献管理ソフト TogoDoc Client と連携して文献情報を管理することも可能です。 今回の番組では登録、検索、タグ管理、文献の推薦といったサービスの基本的な操作についてソフトウエア、ウェブの両方について動画で解説を交えて紹介しております。

  • テクノロジー
  • 2011/03/25 00:27
• あとで読む

  ショウジョウバエ脳の神経画像データベースFlybrain: 15年の蓄積と将来への課題

  4 users

  togotv.dbcls.jp

  本日の統合TVは、2010年10月5日の統合(105)の日に東京大学武田ホールにて開催された4省庁（文部科学省、厚生労働省、農林水産省、経済産業省）合同シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ〜10年先のデータベースを考える」から、東京大学分子細胞生物学研究所 伊藤啓先生による「ショウジョウバエ脳の神経画像データベースFlybrain: 15年の蓄積と将来への課題」をお送りします。

  • 学び
  • 2010/12/11 10:53

  • 研究
• あとで読む

  生命科学のための情報統合とテキストマイニング

  4 users

  togotv.dbcls.jp

  本日の統合TVは、2010年10月5日の統合(105)の日に東京大学武田ホールにて開催された4省庁（文部科学省、厚生労働省、農林水産省、経済産業省）合同シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ〜10年先のデータベースを考える〜」から、東京大学大学院情報学環、マンチェスター大学計算機科 辻井潤一先生による「生命科学のための情報統合とテキストマイニング」をお送りします。

  • 学び
  • 2010/11/25 17:11

  • 研究

次のページ