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最終更新: 2005年 2月 24日 (木曜日) 12時25分 (1.2:Rのmaptoolsだけでの実現方法を追記) このページは2004年8月のベトナムでゲアン省の塗り分け地図を作ったときのメモを下敷きにしている。が,ゲアン省の地図ではあまりピンと来ないかもしれないので,群馬県の地図にした場合で説明する。 Epi Infoとは 米国CDCが開発し,無料で配布しているデータマネジメント環境である。Rとの大きな違いは,(1)入力フォームを設計してデータ入力ができる,(2)標準データ形式がMS-Accessと互換,(3)メニュー操作が標準(コマンド打ちも可能)で,複数の言語で既に開発されているメニューファイル(これもMS-Access形式なので自分で編集することもできる)を差し替えて設定することで,日本語版,フランス語版,中国語版,などが簡単にできる,(4)カバーしている統計処理の種類はRに
R による保健医療データ解析演習 中澤 港 rev 1.00 / 7-Nov-2007 3 目次 第 1 章 R の導入とデータ入力 9 1.1 統計処理ソフトの選択 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 1.2 データ入力 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 1.3 欠損値について . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 1.4 R での読み込みと基本操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.5 課題 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
このページは,Rにどうやってデータを読み込ませて使うかを,できるだけ丁寧に説明することを目的とする。 最終更新: 2006年 6月 9日 (金曜日) 14時10分 ごく少ないデータの場合 データ数がごく少ない場合は,Rのプログラム内で直接付値すればいい。例えば,身長155 cm,160 cm,170 cmの3人の平均(mean)と標準偏差(sd)を出すためには,
R 入門 R ノート: データ解析とグラフィックスのためのプログラミング環境 Version 1.7.0 (2003-04-16) W. N. Venables, D. M. Smith and the R Development Core Team Copyright c 1990 W. N. Venables Copyright c 1992 W. N. Venables & D. M. Smith Copyright c 1997 R. Gentleman & R. Ihaka Copyright c 1997, 1998 M. Maechler c 1999 Permission is granted to make and distribute verbatim copies of this manual provided the copyright notice and th
連絡先 中澤 港(なかざわ みなと)<nminato@med.gunma-u.ac.jp> 郵便番号 371-8511 群馬県前橋市昭和町3-39-22 群馬大学大学院医学系研究科 社会環境医療学講座 公衆衛生学分野 直通電話 027-220-8011(FAX兼用) 分野事務室:電話 027-220-8013 / FAX 027-220-8016 サーバ概要 | アクセス統計(LAN内からのみ参照可) | リンクと引用について
最新の更新: December 18, 2008 (THU) . 当初ばらばらにメモしていたのだが,見失いそうなので集約してみた。日常的な使い方としては,SONYの首掛け型ヘッドセットDR-NX2SFをつないで通勤中に音楽を聞いたり,ハンズフリー通話をしたりしている。音楽を聞かない待ち受け時はヘッドセットを外しておかなくてはいけないので,コネクタの蓋が壊れないか心配だが,今のところ問題ない……って,1ヶ月も経たないのに問題があっては困るが。 情報源リンク集 WILLCOM | WILLCOM 03 WILLCOM 03:シャープ WILLCOM 03 WS020HS - WILLCOM通話・モバイル定額・GPS位置情報 Wiki WILLCOM 03への機種変更データベース W-ZERO3 ツールMEMO W-ZERO3 2ch情報まとめ(wiki) ITmedia+Dモバイルの「WILL
疫学研究は,さまざまな分野に応用されており,それぞれ「○×疫学」と分野や対象名を冠した専門研究分野となっている。これらを概観することで,疫学の応用的な価値がわかると思われる。テキスト「疫学」では第4章の後半に触れられている。また,理論疫学については感染症の疫学がベースになっているので,第16章も参照されたい。 古典疫学(Classic Epidemiology) "A Dictionary of Epidemiology" には出てこない単語である。定まった概念があるわけではないが,既に明確な危険因子やライフスタイル因子が明らかにされ因果関係が確立されたものと考えられる古典的な研究を古典疫学と呼ぶことがある。フラミンガム研究による虚血性心疾患,日本における脳卒中の疫学など。喫煙と肺がんの関係もここに含まれるであろう。既に因果関係が確立したものをさらに研究する意味は,予防対策の定量的効果を調
この文書の元は1995年頃,パソコン通信のボードに書き込んだものである。それを若干改変して,1997年4月頃,喫茶MLで話題になったときに投稿した。今回,青空MLで話題になったので([4561],[4569],[4570],[4571]),若干の新しい情報を追加し,webで公開することにした。 最終更新: 2002年 9月 17日 (火曜日) 18時45分 他のサイトへのリンク ●「アルミニウムと健康」(日本アルミニウム協会提供) 提供者の立場から考えても当然のことながら,肯定的言説には激しい否定的言説をぶつけている。 ●日本アルツハイマー病協会「予防」のところと「資料」のところに,いくつかの疫学研究の結果が紹介されているけれども,このサイトの重点はケアにあるように思う。 アルミニウムそのものとアルツハイマー病の関係について ●Garruto RM (1991) Pacific
最終更新: January 7, 2006 (SAT) 11:48 (リンク切れ修正) 書誌情報 著者:福岡伸一 題名:もう牛を食べても安心か 出版社:文藝春秋(文春新書) 発行:2004年12月20日第一刷 外形:新書判,242ページ ISBN: 4-16-660416-3(Amazon | bk1) タイトルは本書のテーマの一部に過ぎない。てっきりエリック・シュローサーみたいな米国の食(とその安全政策)の駄目さを批判することに主眼がある本かと思ったら,もっとずっと視野が広く,非常に示唆に富んだ内容だった。一読の価値はあると思う。ただ一方では,ある意味で物凄くナイーヴであり,プロパガンダ的であり,偏ってもいる(後で具体的に指摘する)。たぶん,こうやってストレートに主張したら,リスク論とは平行線で議論が噛みあわないし,リスク論なら考慮してくれる一般の人や政府関係者も,「そういう考え方もある
東京大学 | 大学院医学系研究科 | 国際保健学専攻 | 人類生態学教室TOP | 2nd 社会統計学(高崎経済大学非常勤講義) (分割版目次) トップ | 更新情報 | 研究と教育 | 業績 | 計算機 | 写真 | 枕草子 | 著者 | 目安箱 | 書評 | 非常勤 最終更新: 2002年2月19日 火曜日 12時12分 第1回 「社会統計学とはどういう学問か」(2001年9月20日) 講義概要 社会統計学=社会調査データを分析する統計学 ▼前期「社会調査」で触れたように,社会調査には「社会の諸側面の科学的探究」という側面がある。 ▼社会を構成する全要素の把握を直接することはできないので,サンプリングによる標本調査が行われたり,いくつかの尺度で社会の断面を切り取ったりして調査データを得る。そのデータから,本来の社会全体を再構成し,また仮説を検証する原理として,統計学が用いられる。 統計
最終更新: 2008年 9月 5日 (金曜日) 12時42分 :平均値の差の検定について加筆修正 このページは,適切な統計手法を既に知っているけれども,それに対応するRの関数がわからない人のために,一覧表を提供する目的で作成した。しかし,統計手法を網羅することは事実上不可能なので,基礎的な解析に絞ることにした。どうせ基礎的な解析に絞るなら使う順番に出ている方が便利だろうと判断し,一般的な手順を同時に示すことにした(多少煩雑なのでまとめ関数も作ってみた)。ただし,グラフィカルな表示は必須であるにしても,デザインベースな解析では常に正確な確率を出すというのも一つの考え方だし,モデルベースな解析ならglm()やnlm()をきわめるとか,関数定義してoptim()をきわめるというのも一つの考え方であろうから,この手順が常にマニュアル的に適用可能とは限らない。 なお,ここでは慣例に従って(たぶん現状
最終更新: May 29, 2006 (MON) 19:51 (書評掲示板より採録) 書誌情報 著者:佐藤俊樹 題名:不平等社会日本 出版社:中公新書 発行:2000年6月第一刷 外形:新書判, 208ページ ISBN: 4-12-101537-1 (amazon) 著者は東京大学国際社会科学専攻相関社会科学コース助教授。SSMという大規模社会調査データを統計解析して,見かけの機会均等とは違って日本は実は不平等な階級社会なのだと論じたのが話題を呼んで,ベストセラーになった本であるが,実はかなりトンデモ本に近い。 論理がいったりきたりするし,同じ主張の繰り返しが多いし,主観的解釈とデータから言えることが不分明だし,卒業論文だったら3点満点の2点くらいではないだろうか。批判するという目的がなかったら投げ出したいくらいだと読んでいて何度も思った。以下,具体的に批判するので,反論があればここに書き
最終更新: 2004年 4月 15日 (木曜日) 07時42分 (MTの図も追加) このページは,GPLに従って配布されているRを使ってシミュレーションをした例をメモしておくために作成した。Rについての詳細は,統計処理ソフトウェアRについてのTipsを参照されたい。 Rでは,1.7.0からデフォルトのRNGがメルセンヌツイスターとなった。制御構造も簡単に書ける上,グラフ作成までできるので,構成要素が単純な配列で示せるようなシミュレーションに使うにはCよりも向いていると思う。 なお,RNGはシミュレーションで確率的なイヴェントを表すために使うわけだが,メルセンヌ・ツイスターの利点は,周期がほぼ10の6000乗くらいと長く,多次元疎結晶構造もほとんど問題にならないところにある。古典的には乗算合同法を含む線型合同法がよく用いられてきたが,周期の短さと多次元疎結晶構造が線型合同法の欠点であることは
このページは表記の本(奥付では2007年12月25日刊行。12月19日現在,Amazonで予約可になりましたが,Amazonでは12月27日刊行となっています)についての情報を掲載するためのものです。コメントや質問はWikiまたはメールでお願いします。 書誌情報 著者:中澤 港 題名:Rによる保健医療データ解析演習 出版社:ピアソン・エデュケーション(本書の紹介) 発行:2007年12月第一刷 外形:B5判,288ページ 価格:税込み3,150円(高くなってしまってごめんなさい) ISBN:978-4-89471-755-8(Amazon | bk1) 正誤表 以下の誤りについて,お詫び申し上げます。出版物では可及的速やかに(つまり,増刷の機会があれば,ということですが)修正します。 (2008年8月27日記)なお,第6章第2節「独立2標本の平均値の差の検定」(p.74〜p.78)において
医学における Rの利用入門 2006 年 7 月 18 日-19 日 中澤 港(群馬大学大学院医学系研究科) E-mail: nminato@med.gunma-u.ac.jp 1 R について R は,GNU General Public License Version 2 に従って∗1 配布されている,オープンソースで拡張性が高いデータ解析環 境である。誰でも自由に無料で使うことができるのが最大の利点である。世界中の研究者が GIS を含む空間統計解析やゲノ ム解析などに至るまでさまざまな追加ライブラリを公開しているし∗2 ,自分で新しい拡張関数を付け加えることもできる。 オープンソースということは,誰でもその気になれば計算の中身をインプリメンテーションレベルでチェックできること を意味する。これは,商用ソフトにはありえない利点である。商用ソフトでは,利用している計算式はわかっても,
(2002年度の講義概要) 対象学年・開講時期・教室 全学の1年〜4年を対象とした基礎教養科目。生活科学部生活環境学科1年を対象とする「基礎統計学」を兼ねる。後期,F204 補講期間と試験期間の調整の都合上,暫くの間15回目として予定していた補講ができなくなり,その内容は14回目に組み込むことにしたので,シラバス通りに,講義14回で,2月5日に試験を実施することになった。注意されたい。 講義の目的と概要 およそ世の中のすべての現象は不確実性,予測不可能性を含んでいる。とくに人間が絡む現象はそうである。しかし,予測能力がきわめて大きいことはヒトという動物の特徴であり(そう,リチャード・ドーキンスも語っている通り),我々は不確実ながらも先の見通しを立てて,何とかうまく生きていこうと考えざるを得ない。 では,どうやって見通しを立てればいいのだろうか? 不確実で不安定な現象でも,数多く集めれば,何
最終更新: 2004年 4月 15日 (木曜日) 07時44分 ここからダウンロードできるのは,東京工業大学の間瀬教授が日本語訳して公開しているR関連の文書の.texiファイルの日本語文字コードをShift JISに変換し(その後,Windows版pTeXのバージョンアップのおかげだと思うが,変換の必要がなくなった),Windows版のpTeXでコンパイルし,dvipdfmでpdf化したものである。手作業なので,今後の間瀬教授のサイトにおけるバージョンアップに追従する保証はできないが,フォントをビットマップ展開していないので,2002年7月31日現在のところ,学芸大の森厚さんのサイトにあるpdfファイルよりもずっとサイズが小さくなっているのが利点であろう。 ダウンロードできるファイルのリスト R-intro.jp.pdf (488,794 bytes): 入門マニュアル。100ページ。 (
群馬大学 | 医学部 | サイトトップ 人口学 (Demography / Population Studies) Last updated on February 19, 2008 (TUE) 11:17 (更新内容:文献追加) はじめに 世界人口が60億になろうとしている現在,人類の生存を考える上で,人口学は欠くことのできない学問である。人口とはごく単純にいえばヒトの数であり(注1),人口学とはそれにかんする法則性やメカニズムを研究する学問であるといえる。 英語で人口学をあらわす言葉にはdemographyとpopulation studiesの2つがあり,それぞれ上で述べた法則性の研究とメカニズムの研究に対応している。法則性の研究は形式人口学あるいは人口統計学とも呼ばれることがある。法則性を抜きにした純粋なメカニズムの研究というものはありえないので,population studie
群馬大学 | 医学部 | サイトトップ | 人口学 人口ピラミッドの作り方 (How to make population pyramid) 最終更新: November 10, 2005 (THU) 19:25 (R-2.0.0以降ではインストールできないことに気づいたので) このページの目的は,無料で簡単に人口ピラミッドを描く方法を説明することである。Windows環境での説明をするが,使うソフトはどちらもLinux版やFreeBSD版やMac版があるので,おそらくそれらの環境にも応用可能だろう。 用意するソフトウェアとインストール方法概要 おそらく,全部で100 MBくらいのディスク容量が必要である。OpenOffice.orgを快適に使うには,少なくとも256 MB以上のメモリと高速なハードディスクを備えたコンピュータを使うことをお薦めする。Windowsなら,OSのバージョンは2
最終更新: 2007年 10月 26日 (金曜日) 11時32分 このページでは,オープンソースまたはGPLに準じたライセンスで配布されていて無料で使えるソフトウェアを,インストールしたり使ったりする上で役に立ちそうな情報を掲載したいと思う。 文書作成,プレゼンテーション,表計算等 OpenOffice.org (home | OpenOffice.org 日本ユーザ会は,ja.oo.o,ja.oo.oのミラー(見え方は異なる),oooug.jp,ドキュメントプロジェクトなど複数のサイトで活動中) これまで無闇に高いライセンスに耐えながらMS Officeを使ってきたわけだが,今後定期的に(必要ないのに)バージョンアップさせられるのはどうにも癪に障るので,代替品を探していた。とくに,学生に使わせたりするのに,何十台分ものライセンスを更新しつづける予算を取るのは困難が予想される。そこで見つけ
R による統計解析の基礎 中澤 港 3 目次 第 1 章 統計学とは何だろうか? 9 1.1 統計学の歴史 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 1.2 不確実性とランダム(乱雑さ) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 1.3 統計解析の手順 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.4 統計解析の2大方針 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 1.5 統計解析の道具 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 第 2 章
研究業績 | Tasimboko Project | フィールドワーク | 予定表 | Site Map | Wiki | Software Tips | R | WILLCOM 03設定メモ リンク集:一般情報リンク | セキュリティ関連リンク | 常用 | 書評 Latest update on 2008年10月3日 (金) at 21:04:48. 専門分野 公衆衛生学 | 人類生態学 | 人口学 講義課目 「医学情報処理演習」(医学科2年生)→テキスト『Rによる保健医療データ解析演習』サポートページ 「大学院実験基本技術(医学統計学)」(大学院) | 「公衆衛生学」(医学科3年生・分担) 教養のオムニバス講義『生命科学の前線』2006年度「鉄栄養と健康」(配布資料,プレゼン) 教養のオムニバス講義『情報処理入門』2007年度「情報倫理」(配布資料,pdf形式で約1 MB) 1年生
枕草子 (My Favorite Things)補遺・その3 「進化:ダーウィンを継ぐもの」 対談:ドーキンス vs レニエ Richard Dawkins and Jaron Lanier "Evolution: The discent of Darwin", Psychology Today Translated by Minato NAKAZAWA, 2001. Last Update on January 12, 2001 (FRI) 09:22 . レニエ: 私が心配なのは,進化という言葉が,それがなければほとんど共通にもつものがない人たちに,間違った使い方をされつつある,ということです。「ニューエイジ」の人たちの一つの旗印になってきているし,多くのハードサイエンスでもそうですね。このことで,私は際限無くいらいらしています。それというのも,進化は,悪と理解されるべき唯一の自然の
最終更新: 2008年 8月 27日 (水曜日) 15時35分 このページでは,国際共同研究のオープンソースなプロジェクトで開発され,GNU GPLに従って公開,配布されている高機能な統計ソフトであるRについてのTipsを扱う。 News/更新情報 保管庫1(2004年1月まで) | 保管庫2(2004年2月から) 保管庫内の主なトピック:平方和(SS)|「Rによる統計解析の基礎」(保管庫外だがサポート掲示板|正誤表)|オッズ比 |1.6.0|1.6.1|1.6.2|1.7.0|1.7.1|1.8.0 | 1.8.1|1.9.0|1.9.1|2.0.0|2.0.1|2.1.0|2.1.1|2.2.0|2.2.1|2.3.0|2.3.1|2.4.0|2.4.1|2.5.0|2.5.1|2.6.0|2.6.1|2.6.2|2.7.0 R News Vol.8/1公開(2008年6月5日) ●5
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