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インタビュー
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* 濃度や剤形が異なる同一有効成分 [ DRUG | BRITE | KEGG2 | KEGG ] Last updated: October 18, 2022
KEGG DGROUP は、構造的・機能的に類似の医薬品グループとして KEGG DRUG の D番号エントリをまとめたものです。グループには以下の5つのタイプがあり、それぞれ DG番号で識別されます。 Chemical - 塩や水和状態などの違い以外は同一の化学構造グループ Structure - 類似の基本骨格などをもつ構造グループ Target - 同一ターゲットに作用するグループ Class - 作用機序などに共通性がある医薬品クラス Metabolism - 薬物代謝酵素と薬物トランスポーターの基質・阻害・誘導に関するグループ 化学構造グループは、国によって多少異なる化学構造でも実質的に同一の有効成分として扱うために用いられています。
検索範囲: JAPIC ID、KEGG DRUG、総称名、一般名、一般名（欧名）、製剤名、YJ CODE
かぜの諸症状（鼻水, 鼻づまり, くしゃみ, のどの痛み, せき, 悪寒, 発熱, 頭痛, 関節の痛み, 筋肉の痛み）の緩和
配列解析の出発点は、ダイナミックプログラミング（DP: dynamic programming）法による２つの配列アライメントを理解することである。いま２つの文字列が与えられたときに、適当な場所にギャップを入れてずらすことにより、両者で対応する文字の一致数が最大になるような並べ方を探してみよう。上の図に２つの文字列ＡＩＭＳとＡＭＯＳを例として、ダイナミックプログラミング法の原理が示されている。この場合 ＡＩＭ−Ｓ Ａ−ＭＯＳ のように−で示した位置にギャップを入れて並べると３つの文字が一致する。これが最大の一致数に対応したアライメント、すなわち最適アライメント（optimal alignment）で、この問題の解となる。アライメントの問題とは結局、ある評価関数（この例では文字の一致数）を最適にする最適化問題に帰着するのである。 ダイナミックプログラミング法による解法は、比較する配列を横方向
KEGG: 生命システム情報統合データベース KEGG2 - 目次のページ KEGG PATHWAY - システム情報: パスウェイ KEGG BRITE - システム情報: オントロジー KEGG Organisms - 生物種ごとの入口 KEGG GENES - ゲノム情報 KEGG LIGAND - ケミカル情報 KEGG MEDICUS - 疾患・医薬品情報
Each pathway map is identified by the combination of 2-4 letter prefix code and 5 digit number (see KEGG Identifier). The prefix has the following meaning: mapmanually drawn reference pathway koreference pathway highlighting KOs ecreference metabolic pathway highlighting EC numbers rnreference metabolic pathway highlighting reactions <org>organism-specific pathway generated by converting KOs to ge
GenomeNet Database Resources DBGET: Integrated Database Retrieval System DBGET search LinkDB search SPARQL endpoint available KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes KEGG2 - Table of contents KEGG PATHWAY - Systems information: pathways KEGG BRITE - Systems information: ontologies KEGG Organisms - Organism-specific entry points KEGG GENES - Genomic information KEGG LIGAND - Chemical informat
KEGG organism genes and proteins Virus genes and proteins Virus mature peptides Functionally characterized proteins from literature
KEGG API はプログラムなどから KEGG を利用するためのウェブサービスです。 前半では、KEGG データベースから情報を取得したり検索したりするために KEGG API を使う方法を説明します。後半のリファレンスで KEGG API の全機能を 解説します。例として主に Ruby 言語を使って解説しますが、SOAP と WSDL を 扱うことのできる言語（Perl, Python, Java など）であれば簡単に KEGG API を 利用することができます。 目次 イントロダクション KEGG API の使い方 Ruby の場合 Perl の場合 Perl の注意点 Python の場合 Java の場合 KEGG API リファレンス WSDL ファイル 用語の凡例 戻り値のデータ型 SSDBRelation 型, ArrayOfSSDBRelation 型 MotifRes
KEGG is a database resource for understanding high-level functions and utilities of the biological system, such as the cell, the organism and the ecosystem, from molecular-level information, especially large-scale molecular datasets generated by genome sequencing and other high-throughput experimental technologies. See Release notes (September 1, 2024) for new and updated features.
バイオインフォマティクス入門コース 理論分子生物学（京都大学理学部）講義資料 ゲノム解析とポストゲノム解析 （参考資料）ヒューマンゲノム計画とニューバイオフィジックス データベース技術とインターネット （参考資料）ゲノムネットのデータベースサービス概要 分子生物学データベース （課題1）データベース検索（DBGET/LinkDB, PubMed） （課題2）タンパク質立体構造グラフィックス（RasMol, Chime） 配列アライメントとホモロジー検索 （課題3）ホモロジー検索（FASTA, BLAST） （課題4）マルチプルアライメント（CLUSTALW） （資料）式一覧 構造予測と機能予測 （課題5）モチーフ検索（MOTIF, PFAM） （課題6）タンパク質二次構造予測、膜貫通部位予測（nnpredict, SOSUI） （課題7）タンパク質立体構造分類（SCOP, CATH） ネ
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