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Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? Nextremer Advent Calendar 2016の14日目の記事です。 医薬品設計含めケモインフォマティクスの分野でニューラルネットワークがどのように活用されているのか興味があり調べてみました。 簡単に医薬品設計について説明してから、これとニューラルネットワークの最近の動向について記述します。また最後に今回興味を持つきっかけとなった、Variational Auto Encoderを元にして新しい化学構造を生成する生成モデルベースのアプローチについても紹介したいと思います。 自分は有機化学を少しかじった程度なので、誤り等あっ

最近、機械学習にどっぷり浸かっていますが、Jupyter Notebookを使うと勉強が捗るので重宝しています。せっかくブラウザで利用できるので、ブラウザさえあればいつでもどこでも―自分のお気に入りノートPCが手元になくとも、自分の「ノート」を開けるような環境が欲しくて作ってみました。 概要 DigitalOcean上にDockerでJupyter Notebook環境を構築します。 DigitalOceanは格安のいわゆるIaaSです。時間単位の課金で、2015/11/21時点で0.86円/時($0.007/時)で利用できます。DigitalOceanのWebページ上でサーバの電源をOFFにしておけばお金がかからないので、勉強したい時だけ電源をONにするといった利用が可能です。 Dockerは言わずと知れたコンテナ型のアプリケーションデプロイツールです、ここではJupyter Noteb

Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? PlayCanvasはHTMLで動作するゲームを作成するためのクラウドベースのゲームエンジンです。詳細は参考ページ1に譲りますが、Unityライクなエディタを用いてハイクオリティなゲームを作成することが可能で、例えば以下のようなプロダクトが本家紹介ページにて紹介されています: SWOOOP BMW i8 これらはPC、スマートフォン限らず任意のブラウザ上で動作し、実際に手元のiPhone(iOS 8.4.1でした)でも動かすことができました。 ここではPlayCanvasで簡単なゲームを作成してPlayCanvasの使い方について紹介し

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Vert.xとは、公式ページより JVM上にリアクティブアプリケーションを構築するためのツールキットです @timfox氏が中心となって、現在2015年6月22日を目標にversion 3が開発されています。この投稿含め何回かに分けてVert.x 3の動くサンプルを実装していこうと思います。 概要 「サービス」はversion 3から導入された概念です。 サービスは任意の機能を実現するVerticleです。 以下にシンプルなサービスの例を示します、このhoge-serviceはデプロイメントされたときにhogeをログ出力するだけのサービスです。 サービスを実現するHogeServiceVerticle.javaの中身は以下の通りです: package com.example.hogeservice.services; import io.vertx.core.AbstractVerticl

Vert.xとは、公式ページより JVM上にリアクティブアプリケーションを構築するためのツールキットです @timfox氏が中心となって、現在2015年6月22日を目標にversion 3が開発されています。この投稿含め何回かに分けてVert.x 3の動くサンプルを実装していこうと思います。 概要 今回は、公式によるWebアプリケーションフレームワークApexを用いてシンプルなRESTサーバを動かしてみます。 Vert.x coreはHTTP、TCP、ファイルシステムへのアクセス等低レベルの機能のみを実現しており、このうえにウェブアプリケーションを構築する際に必要となる多くの機能を提供するのがApexです。Node.jsでいうところのExpress、RubyでいうところのSinatraのようなライブラリです。 今回は簡便のためにデータはオンメモリに保存します、データをデータベースに保存する

ちょっと前になりますが4/1にcomponentの1.0.0-rc1がリリースされました。 今はrc5みたいです、久しぶりにcomponentを触ってみて、ビルドのコマンドが以前より便利になっているようなのでまとめてみます。 サンプルのソースは以下にあります: component buildの構成 npmモジュールの名前がややこしいのですが、以下のような依存関係があります。 component buildは実際にはcomponent/bin/component-buildを実行しますが、このスクリプトが直接依存しているのがcomponent-build、その先にbuilder2.jsがいます。間にcomponent-buildを挟んでいるのは、個々のプロジェクトにカスタマイズされたビルドをしたい場合はこれをフォークして好きなように弄ってくれという意味みたいです。 で、component-b

Amazon Web Services Blogで、今回のAmazon Linux AMI 2014.03リリースにDockerが導入されたことがアナウンスされています。 Docker 0.9 - You can now run Docker containers on the Amazon Linux AMI. さっそく試してみた: 確認する、 $ sudo yum search docker 読み込んだプラグイン:priorities, update-motd, upgrade-helper ================================================================== N/S matched: docker ==============================================================

国内・海外問わずあまり使用例の聞かないcucumber-jsですが、個人的によく使うので使い方を紹介したいと思います。 cucumber-jsを利用しているプロジェクトとしては以下があります: aws-sdk-js 他にcucumber.jsを利用しているプロジェクトをご存知の方いましたら教えてください。 はじめに cucumberについて詳細はWikipediaに譲りますが、簡単にいえばGherkin syntaxでfeatureを定義してこれに対応するステップを実装し受け入れテストを実行します。オリジナルはrubyですがそのJavaScriptバージョンがcucumber-jsです。 ここではcucumber-jsとselenium-webdriverを用いて実際にfeatureとstep、これをサポートするスクリプトファイルを記述して動かしていってみます。実コードは以下にあります。

koaでのテスト ごめんなさい、koajsに浮気しちゃいましたでKoaを紹介しましたが、相変わらずKoaといちゃいちゃしています、今回はKoaで作るアプリケーションのテスティングについてです。 Koaはgeneratorベースでアプリケーションを記述させてくれるフレームワークですが、自分はテスティングも基本的にcoを介してgeneratorベースでテストを書いてみています。coを利用する際はmocha実行時に--harmony-generatorsオプションを指定する必要があります。 実際のコードは前回と同じく以下において有ります(まだまだ網羅できていないですが...) まずはExpressからの変更の影響が一番大きいコントローラのテストです。 コントローラのテスト JSONを返却するだけのAPI用途の場合はsupertestを用いるのが楽です。その場合のテストについてはkoajs/exa

いつもいつもexpressには大変お世話になっています、 でもちょっとした気の迷いからkoaに浮気しちゃいました、 koaの魅力をお伝えして、浮気の言い訳してみます koaについて koaはTJ Holowaychuk他Expressの開発メンバーが開発しているcoベースのnode 0.12向けWebフレームワークです。koaについてはかずぽんさんの以下記事が詳しいです： 浮気現場 浮気現場はここです： 浮気の仕方はこちら： ただのブログアプリです、管理画面のスタイルがまだ中途半端ですが…そのうち更新します。 koaの魅惑 では早速、koaの魅力を懺悔します、以下koaの公式ページより: KoaはExpressチームによる新しいWebフレームワークです、より小さくて、より表現的でロバストなWebアプリーションとAPIのためのフレームワークです。generatorを利用することでコールバック

Node.jsにおいてExpressはWebアプリケーション作成時のほぼデファクトスタンダードですが、こんかいはさらにORMにBookshelfをもちいた場合のユーザ認証です。BookshelfはBackboneを下敷きにプロミスインタフェースを提供するRDB向けORMです。MySQL、PostgreSQL、Sqlite3をサポートしています。バリデーションロジック等をもっておらずシンプルなことが特徴です。 ユーザ認証は多くのアプリケーションにとって必須の機能です。今回は単純なユーザ認証付きのブログアプリケーションを作成してみます。作成したアプリケーションは以下リポジトリにおいて有ります： ルーティングは以下の通り: / 投稿一覧 /posts 投稿一覧 /admin/sessions/new ログイン画面 /admin/posts 管理者向け投稿一覧(ログインしていないとみれない) アプ